SEdb 2.0
  1. Search
  2. Super-enhancer search result of gene-based

Gene overview

Strategies/Algorithm: overlap Ensembl ID: ENSG00000199352
Gene: RNA5S1 Gene type: rRNA
Strand: - External links:
Genomic region: chr1:228610268-228610386 Genome Browser:

Super-enhancer search result of gene-based

GREAT Download bed
SE ID SE Region Sample ID Tissue type Biosample name SE rank Element Common SNP eQTL Risk SNP TFBS CRISPR Cas9 Gene
SE_02_099200039 chr1:228608099-228633889 Sample_02_0992 Mammary gland MDA-MB-231_Par 39 1 56 0 0 0 0 RNA5S11,MIR7641-2,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RNA5S1,RNA5S6,RNA5S10,RNA5S9,RHOU,RNA5S5,DUSP5P1,RNA5S15
SE_02_084100025 chr1:228608184-228648557 Sample_02_0841 Blood THP-1_untr 25 1 214 13 0 0 150 RNA5S11,MIR7641-2,RNA5S1,DUSP5P1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RNA5S6,RHOU,RNA5S10,RNA5S9,RNA5S5,RNA5S15,RNF187
SE_02_085900019 chr1:228608199-228649391 Sample_02_0859 Prostate PC3 19 1 235 14 0 0 150 RNA5S11,MIR7641-2,RNA5S1,DUSP5P1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RNA5S6,RHOU,RNA5S10,RNA5S9,RNA5S5,RNA5S15,RNF187,HIST3H2A
SE_02_088400063 chr1:228608205-228649622 Sample_02_0884 Colon LoVo 63 1 241 14 0 0 150 RNA5S11,MIR7641-2,RNA5S1,DUSP5P1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RNA5S6,RHOU,RNA5S10,RNA5S9,RNA5S5,RNA5S15
SE_02_055500232 chr1:228608206-228620579 Sample_02_0555 Other HAP1_WT 232 1 8 0 0 0 0 MIR7641-2,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RNA5S1,RNA5S6,RHOU,RNA5S5,RNA5S9,RNA5S10,DUSP5P1,RNA5S15
SE_02_057700004 chr1:228608213-228648871 Sample_02_0577 Blood MOLM13_empty 4 1 223 13 0 0 150 RNA5S11,MIR7641-2,RNA5S1,DUSP5P1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RNA5S6,RHOU,RNA5S10,RNA5S9,RNA5S5,RNA5S15
SE_02_139100164 chr1:228608219-228649649 Sample_02_1391 Peripheral blood FE-PD_ALK- 164 1 241 14 0 0 150 RNA5S11,MIR7641-2,RNA5S1,DUSP5P1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RNA5S6,RHOU,RNA5S10,RNA5S9,RNA5S5,RNA5S15
SE_02_111900006 chr1:228608233-228649247 Sample_02_1119 Blood KBM7 6 1 232 14 0 0 150 RNA5S11,MIR7641-2,RNA5S1,DUSP5P1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RNA5S6,RHOU,RNA5S10,RNA5S9,RNA5S5,RNA5S15
SE_02_044600084 chr1:228608239-228647534 Sample_02_0446 Bone osteosarcoma tumor P2 84 1 169 10 0 0 150 RNA5S11,MIR7641-2,RNA5S1,DUSP5P1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RNA5S6,RHOU,RNA5S10,RNA5S9,RNA5S5,RNA5S15
SE_02_058200004 chr1:228608240-228649050 Sample_02_0582 Blood MOLM13_SIK3TQ_HG 4 1 226 13 0 0 150 RNA5S11,MIR7641-2,RNA5S1,DUSP5P1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RNA5S6,RHOU,RNA5S10,RNA5S9,RNA5S5,RNA5S15
SE_02_058100003 chr1:228608251-228648837 Sample_02_0581 Blood MOLM13_empty_HG 3 1 222 13 0 0 150 RNA5S11,MIR7641-2,RNA5S1,DUSP5P1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RNA5S6,RHOU,RNA5S10,RNA5S9,RNA5S5,RNA5S15
SE_02_045300154 chr1:228608256-228649614 Sample_02_0453 Neuroblastoma SJNB3 154 1 241 14 0 0 150 RNA5S11,MIR7641-2,RNA5S1,DUSP5P1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RNA5S6,RHOU,RNA5S10,RNA5S9,RNA5S5,RNA5S15
SE_02_058400003 chr1:228608259-228649351 Sample_02_0584 Lung H1299 WT 3 1 234 14 0 0 150 RNA5S11,MIR7641-2,RNA5S1,DUSP5P1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RNA5S6,RHOU,RNA5S10,RNA5S9,RNA5S5,RNA5S15
SE_02_138900002 chr1:228608265-228649665 Sample_02_1389 Peripheral blood SUP-M2_ALK+ 2 1 241 14 0 0 150 RNA5S11,MIR7641-2,RNA5S1,DUSP5P1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RNA5S6,RHOU,RNA5S10,RNA5S9,RNA5S5,RNA5S15
SE_02_098100010 chr1:228608270-228647424 Sample_02_0981 Brain H3.3K27M-KO_BT245-C4P6 10 1 160 9 0 0 150 RNA5S11,MIR7641-2,RNA5S1,DUSP5P1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RNA5S6,RHOU,RNA5S10,RNA5S9,RNA5S5,RNA5S15
SE_02_102700002 chr1:228608276-228647752 Sample_02_1027 Esophagus KYSE180_1 2 1 180 11 0 0 150 RNA5S11,MIR7641-2,RNA5S1,DUSP5P1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RNA5S6,RHOU,RNA5S10,RNA5S9,RNA5S5,RNA5S15
SE_02_138700071 chr1:228608276-228649594 Sample_02_1387 Peripheral blood Mac-1_ALK- 71 1 241 14 0 0 150 RNA5S11,MIR7641-2,RNA5S1,DUSP5P1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RNA5S6,RHOU,RNA5S10,RNA5S9,RNA5S5,RNA5S15
SE_02_097300062 chr1:228608278-228625744 Sample_02_0973 Brain H3.3K27M-KO_BT245-c4p6-Rx_R2_cells 62 1 29 0 0 0 0 RNA5S11,MIR7641-2,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RNA5S1,RNA5S6,RNA5S10,RHOU,RNA5S5,RNA5S9,DUSP5P1,RNA5S15
SE_02_047900004 chr1:228608281-228648606 Sample_02_0479 Head and neck SCC25 4 1 215 13 0 0 150 RNA5S11,MIR7641-2,RNA5S1,DUSP5P1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RNA5S6,RHOU,RNA5S10,RNA5S9,RNA5S5,RNA5S15
SE_02_138800014 chr1:228608289-228649351 Sample_02_1388 Peripheral blood JB6_ALK+ 14 1 234 14 0 0 150 RNA5S11,MIR7641-2,RNA5S1,DUSP5P1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RNA5S6,RHOU,RNA5S10,RNA5S9,RNA5S5,RNA5S15
SE_02_139000005 chr1:228608314-228648356 Sample_02_1390 Peripheral blood SU-DHL-1_ALK+ 5 1 210 12 0 0 150 RNA5S11,MIR7641-2,RNA5S1,DUSP5P1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RNA5S6,RHOU,RNA5S10,RNA5S9,RNA5S5,RNA5S15
SE_02_057400004 chr1:228608320-228649025 Sample_02_0574 Blood MOLM-13_sgNeg2 4 1 225 13 0 0 150 RNA5S11,MIR7641-2,RNA5S1,DUSP5P1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RNA5S6,RHOU,RNA5S10,RNA5S9,RNA5S5,RNA5S15
SE_02_057500005 chr1:228608328-228649086 Sample_02_0575 Blood MOLM13_sgLKB1e2 5 1 227 13 0 0 150 RNA5S11,MIR7641-2,RNA5S1,DUSP5P1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RNA5S6,RHOU,RNA5S10,RNA5S9,RNA5S5,RNA5S15
SE_02_110600026 chr1:228608332-228648490 Sample_02_1106 Brain NGP 26 1 211 12 0 0 150 RNA5S11,MIR7641-2,RNA5S1,DUSP5P1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RNA5S6,RHOU,RNA5S10,RNA5S9,RNA5S5,RNA5S15
SE_02_147500022 chr1:228608332-228648729 Sample_02_1475 Bone CHLA-25 22 1 219 13 0 0 150 RNA5S11,MIR7641-2,RNA5S1,DUSP5P1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RNA5S6,RHOU,RNA5S10,RNA5S9,RNA5S5,RNA5S15
SE_02_099500012 chr1:228608337-228648710 Sample_02_0995 Blood MOLM-13_empty vector 12 1 217 13 0 0 150 RNA5S11,MIR7641-2,RNA5S1,DUSP5P1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RNA5S6,RHOU,RNA5S10,RNA5S9,RNA5S5,RNA5S15
SE_02_057800005 chr1:228608337-228649218 Sample_02_0578 Blood MOLM-13_sgSIK3e4 5 1 232 14 0 0 150 RNA5S11,MIR7641-2,RNA5S1,DUSP5P1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RNA5S6,RHOU,RNA5S10,RNA5S9,RNA5S5,RNA5S15
SE_02_148000001 chr1:228608344-228649253 Sample_02_1480 Bone MHH-ES-1 1 1 233 14 0 0 150 RNA5S11,MIR7641-2,RNA5S1,DUSP5P1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RNA5S6,RHOU,RNA5S10,RNA5S9,RNA5S5,RNA5S15
SE_02_148800146 chr1:228608349-228620738 Sample_02_1488 Bone TC-71 146 1 9 0 0 0 0 MIR7641-2,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RNA5S1,RNA5S6,RHOU,RNA5S5,RNA5S9,RNA5S10,DUSP5P1,RNA5S15
SE_02_063500016 chr1:228608350-228618009 Sample_02_0635 Synovial sarcoma HSSYII_Untreated 16 1 8 0 0 0 0 MIR7641-2,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RNA5S1,RHOU,RNA5S5,RNA5S6,RNA5S9,RNA5S10,DUSP5P1,RNA5S15
SE_02_147800215 chr1:228608351-228618039 Sample_02_1478 Bone EW-3 215 1 8 0 0 0 0 MIR7641-2,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RNA5S1,RHOU,RNA5S5,RNA5S6,RNA5S9,RNA5S10,DUSP5P1,RNA5S15
SE_02_055200166 chr1:228608364-228620703 Sample_02_0552 Other SYO1 shCt 166 1 8 0 0 0 0 MIR7641-2,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RNA5S1,RNA5S6,RHOU,RNA5S5,RNA5S9,RNA5S10,DUSP5P1,RNA5S15
SE_02_070200004 chr1:228608365-228626577 Sample_02_0702 Bone David_TC71 4 1 32 0 0 0 0 RNA5S11,MIR7641-2,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RNA5S1,RNA5S6,RNA5S10,RHOU,RNA5S5,RNA5S9,DUSP5P1,RNA5S15
SE_02_099300020 chr1:228608365-228642189 Sample_02_0993 Blood MOLM-13_empty 20 1 88 1 0 0 0 RNA5S11,MIR7641-2,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RNA5S1,RNA5S6,RNA5S10,RNA5S9,RHOU,RNA5S5,DUSP5P1,RNA5S15
SE_02_113600667 chr1:228608368-228620556 Sample_02_1136 Bone U2OS-anaphase/telophase 667 1 8 0 0 0 0 MIR7641-2,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RNA5S1,RNA5S6,RHOU,RNA5S5,RNA5S9,RNA5S10,DUSP5P1,RNA5S15
SE_02_106100007 chr1:228608374-228649677 Sample_02_1061 Bone TC71_WT 7 1 241 14 0 0 150 RNA5S11,MIR7641-2,RNA5S1,DUSP5P1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RNA5S6,RHOU,RNA5S10,RNA5S9,RNA5S5,RNA5S15
SE_02_121600385 chr1:228608393-228626563 Sample_02_1216 Blood Jurkat ZBTB1 KO 385 1 31 0 0 0 0 RNA5S11,MIR7641-2,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RNA5S1,RNA5S6,RNA5S10,RHOU,RNA5S5,RNA5S9,DUSP5P1,RNA5S15
SE_02_106000125 chr1:228608413-228620560 Sample_02_1060 Bone TC71_SA2 KO 125 1 6 0 0 0 0 MIR7641-2,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RNA5S1,RNA5S6,RHOU,RNA5S5,RNA5S9,RNA5S10,DUSP5P1,RNA5S15
SE_02_144500414 chr1:228608417-228618035 Sample_02_1445 Adipose SW872_TAZ4SA 414 1 5 0 0 0 0 MIR7641-2,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RNA5S1,RHOU,RNA5S5,RNA5S6,RNA5S9,RNA5S10,DUSP5P1,RNA5S15
SE_02_111200069 chr1:228608470-228647264 Sample_02_1112 T lymphocyte THP-6 T-ALL 69 1 149 8 0 0 150 RNA5S11,MIR7641-2,RNA5S1,DUSP5P1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RNA5S6,RHOU,RNA5S10,RNA5S9,RNA5S5,RNA5S15
SE_02_099000425 chr1:228614666-228624800 Sample_02_0990 Breast cancer brain metastatic variant MDA-MB-231 BrM2 425 1 21 0 0 0 0 RNA5S11,MIR7641-2,RNA5S4,RNA5S1,RNA5S6,RNA5S10,RNA5S2,RNA5S3,RHOU,RNA5S5,RNA5S9,DUSP5P1,RNA5S15
SE_02_093500559 chr1:228616298-228629314 Sample_02_0935 Retinal Pigmented Epithelial RPE188_Con 559 1 48 0 0 0 0 RNA5S11,MIR7641-2,RNA5S1,RNA5S6,RNA5S10,RNA5S9,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RHOU,RNA5S5,DUSP5P1,RNA5S15
SE_02_064000233 chr1:228616791-228625672 Sample_02_0640 Mammary gland MDA-MB-436_DMSO 233 1 21 0 0 0 0 RNA5S11,MIR7641-2,RNA5S1,RNA5S6,RNA5S10,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RHOU,RNA5S5,RNA5S9,DUSP5P1,RNA5S15
SE_02_063500024 chr1:228618258-228626588 Sample_02_0635 Synovial sarcoma HSSYII_Untreated 24 1 24 0 0 0 0 RNA5S11,MIR7641-2,RNA5S6,RNA5S10,RNA5S1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RHOU,RNA5S5,RNA5S9,DUSP5P1,RNA5S15
SE_02_144500424 chr1:228618300-228626916 Sample_02_1445 Adipose SW872_TAZ4SA 424 1 42 0 0 0 0 RNA5S11,MIR7641-2,RNA5S6,RNA5S10,RNA5S1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RHOU,RNA5S5,RNA5S9,DUSP5P1,RNA5S15
SE_02_068200514 chr1:228618804-228632104 Sample_02_0682 Blood Kasumi-1 514 1 48 0 0 0 0 RNA5S11,MIR7641-2,RNA5S6,RNA5S10,RNA5S9,RNA5S1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RHOU,RNA5S5,DUSP5P1,RNA5S15
SE_02_055200336 chr1:228620852-228628863 Sample_02_0552 Other SYO1 shCt 336 1 46 0 0 0 0 RNA5S11,MIR7641-2,RNA5S10,RNA5S9,RNA5S1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RHOU,RNA5S5,RNA5S6,DUSP5P1,RNA5S15
SE_02_148800020 chr1:228620860-228649677 Sample_02_1488 Bone TC-71 20 1 231 14 0 0 150 RNA5S11,RNA5S1,DUSP5P1,MIR7641-2,RHOU,RNA5S10,RNA5S9,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RNA5S5,RNA5S6,RNA5S15
SE_02_139200275 chr1:228620873-228649731 Sample_02_1392 Peripheral blood Mac-2A_ALK- 275 1 233 14 0 0 150 RNA5S11,RNA5S1,DUSP5P1,MIR7641-2,RHOU,RNA5S10,RNA5S9,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RNA5S5,RNA5S6,RNA5S15
SE_02_147800597 chr1:228620884-228626972 Sample_02_1478 Bone EW-3 597 1 41 0 0 0 0 RNA5S11,MIR7641-2,RNA5S10,RNA5S1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RHOU,RNA5S5,RNA5S6,RNA5S9,DUSP5P1,RNA5S15
SE_02_113600461 chr1:228620885-228635473 Sample_02_1136 Bone U2OS-anaphase/telophase 461 1 61 1 0 0 0 RNA5S11,MIR7641-2,RNA5S10,RNA5S9,RNA5S1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RHOU,RNA5S5,RNA5S6,DUSP5P1,RNA5S15
SE_02_106000599 chr1:228621047-228626959 Sample_02_1060 Bone TC71_SA2 KO 599 1 34 0 0 0 0 RNA5S11,MIR7641-2,RNA5S10,RNA5S1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RHOU,RNA5S5,RNA5S6,RNA5S9,DUSP5P1,RNA5S15
SE_02_055500106 chr1:228621213-228639063 Sample_02_0555 Other HAP1_WT 106 1 70 1 0 0 0 RNA5S11,MIR7641-2,RNA5S10,RNA5S9,RNA5S1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RHOU,RNA5S5,RNA5S6,DUSP5P1,RNA5S15
SE_02_107100178 chr1:228621620-228625983 Sample_02_1071 Blood Jurkat_WT 178 1 10 0 0 0 0 RNA5S10,MIR7641-2,RNA5S1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RHOU,RNA5S5,RNA5S6,RNA5S9,DUSP5P1,RNA5S15
SE_00_005100398 chr1:228622130-228643757 Sample_00_0051 Adrenal gland adrenal gland 30y 398 13 69 1 0 0 0 MIR7641-2,RNA5S10,RNA5S9,RNA5S1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RHOU,RNA5S5,RNA5S6,DUSP5P1,RNA5S15
SE_02_099400138 chr1:228622218-228637720 Sample_02_0994 Blood MOLM13_SIK3TQ 138 1 63 1 0 0 0 MIR7641-2,RNA5S10,RNA5S9,RNA5S1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RHOU,RNA5S5,RNA5S6,DUSP5P1,RNA5S15
SE_02_138600086 chr1:228622871-228643411 Sample_02_1386 Peripheral blood Karpas-299_ALK+ 86 15 59 1 0 0 0 MIR7641-2,RNA5S10,RNA5S9,RNA5S1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RHOU,RNA5S5,RNA5S6,DUSP5P1,RNA5S15
SE_02_101900016 chr1:228622897-228642084 Sample_02_1019 Umbilical cord HUDEP2_Day 16 10 59 1 0 0 0 MIR7641-2,RNA5S10,RNA5S9,RNA5S1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RHOU,RNA5S5,RNA5S6,DUSP5P1,RNA5S15
SE_02_113400158 chr1:228622910-228642172 Sample_02_1134 Bone U2OS-interphase 158 11 59 1 0 0 0 MIR7641-2,RNA5S10,RNA5S9,RNA5S1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RHOU,RNA5S5,RNA5S6,DUSP5P1,RNA5S15
SE_00_005400111 chr1:228623075-228643602 Sample_00_0054 Pancreas pancreas 30y 111 24 59 1 0 0 0 MIR7641-2,RNA5S10,RNA5S9,RNA5S1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RHOU,RNA5S5,RNA5S6,DUSP5P1,RNA5S15,HIST3H3
SE_02_132201302 chr1:228623128-228642306 Sample_02_1322 Connective Tissue HT1080_WT 1302 10 59 1 0 0 0 MIR7641-2,RNA5S10,RNA5S9,RNA5S1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RHOU,RNA5S5,RNA5S6,DUSP5P1,RNA5S15
SE_02_082600446 chr1:228623261-228641650 Sample_02_0826 Stomach gastric tumor 446 11 59 1 0 0 0 MIR7641-2,RNA5S10,RNA5S9,RNA5S1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RHOU,RNA5S5,RNA5S6,DUSP5P1,RNA5S15
SE_02_062900511 chr1:228623339-228643004 Sample_02_0629 Gastrointestinal Stromal GIST-T1_DMSO 511 9 59 1 0 0 0 MIR7641-2,RNA5S10,RNA5S9,RNA5S1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RHOU,RNA5S5,RNA5S6,DUSP5P1,RNA5S15
SE_02_104800161 chr1:228623379-228643781 Sample_02_1048 Peripheral blood CD4+ cell_UNTREATED 161 18 59 1 0 0 0 MIR7641-2,RNA5S10,RNA5S9,RNA5S1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RHOU,RNA5S5,RNA5S6,DUSP5P1,RNA5S15
SE_02_155300626 chr1:228623394-228643384 Sample_02_1553 Gastrointestinal Stromal GIST-2_KIT e11 626 12 59 1 0 0 0 MIR7641-2,RNA5S10,RNA5S9,RNA5S1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RHOU,RNA5S5,RNA5S6,DUSP5P1,RNA5S15
SE_02_108000280 chr1:228623417-228636310 Sample_02_1080 Muscle JR1 shCtrl 280 1 59 1 0 0 0 MIR7641-2,RNA5S10,RNA5S9,RNA5S1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RHOU,RNA5S5,RNA5S6,DUSP5P1,RNA5S15
SE_02_156001231 chr1:228623605-228642577 Sample_02_1560 Gastrointestinal Stromal GIST-9_PDGFRA e18 1231 10 59 1 0 0 0 MIR7641-2,RNA5S10,RNA5S9,RNA5S1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RHOU,RNA5S5,RNA5S6,DUSP5P1,RNA5S15
SE_02_122700517 chr1:228623610-228643052 Sample_02_1227 Bone marrow U266 517 9 59 1 0 0 0 MIR7641-2,RNA5S10,RNA5S9,RNA5S1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RHOU,RNA5S5,RNA5S6,DUSP5P1,RNA5S15
SE_02_147000610 chr1:228623625-228642103 Sample_02_1470 Umbilical Vein H441 610 8 59 1 0 0 0 MIR7641-2,RNA5S10,RNA5S9,RNA5S1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RHOU,RNA5S5,RNA5S6,DUSP5P1,RNA5S15
SE_02_135200678 chr1:228623628-228642109 Sample_02_1352 Mammary gland MDA-MB-231-Erbeta_E2 678 8 59 1 0 0 0 MIR7641-2,RNA5S10,RNA5S9,RNA5S1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RHOU,RNA5S5,RNA5S6,DUSP5P1,RNA5S15
SE_02_095800420 chr1:228623638-228643335 Sample_02_0958 Brain H3.3K27M_Tumor_BT245-X0-2-Rx_xenograft 420 7 59 1 0 0 0 MIR7641-2,RNA5S10,RNA5S9,RNA5S1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RHOU,RNA5S5,RNA5S6,DUSP5P1,RNA5S15
SE_02_135400526 chr1:228623656-228643116 Sample_02_1354 Mammary gland MDA-MB-231-Erbeta_E2_TNFa 526 9 59 1 0 0 0 MIR7641-2,RNA5S10,RNA5S9,RNA5S1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RHOU,RNA5S5,RNA5S6,DUSP5P1,RNA5S15
SE_02_097600200 chr1:228623659-228642696 Sample_02_0976 Brain H3.3K27M-KO_DIPGXIII-c5p5-Rx_R1_cells_h3k27ac 200 11 59 1 0 0 0 MIR7641-2,RNA5S10,RNA5S9,RNA5S1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RHOU,RNA5S5,RNA5S6,DUSP5P1,RNA5S15
SE_02_116400031 chr1:228623681-228642137 Sample_02_1164 Testis pachytene spermatocytes 31 16 59 1 0 0 0 MIR7641-2,RNA5S10,RNA5S9,RNA5S1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RHOU,RNA5S5,RNA5S6,DUSP5P1,RNA5S15
SE_02_135100437 chr1:228623717-228642623 Sample_02_1351 Mammary gland MDA-MB-231-Erbeta_vehicle 437 7 59 1 0 0 0 MIR7641-2,RNA5S10,RNA5S9,RNA5S1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RHOU,RNA5S5,RNA5S6,DUSP5P1,RNA5S15
SE_02_085400137 chr1:228623717-228643084 Sample_02_0854 Glioblastoma Glioblastoma neurosphere cell_HF-2354 137 7 59 1 0 0 0 MIR7641-2,RNA5S10,RNA5S9,RNA5S1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RHOU,RNA5S5,RNA5S6,DUSP5P1,RNA5S15
SE_02_135300356 chr1:228623730-228642108 Sample_02_1353 Mammary gland MDA-MB-231-Erbeta_TNFa 356 9 59 1 0 0 0 MIR7641-2,RNA5S10,RNA5S9,RNA5S1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RHOU,RNA5S5,RNA5S6,DUSP5P1,RNA5S15
SE_02_143300923 chr1:228623740-228642165 Sample_02_1433 Bone A673 STAG2 null 923 12 59 1 0 0 0 MIR7641-2,RNA5S10,RNA5S9,RNA5S1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RHOU,RNA5S5,RNA5S6,DUSP5P1,RNA5S15
SE_02_155600538 chr1:228623751-228643413 Sample_02_1556 Gastrointestinal Stromal GIST-5_KIT e9 538 10 59 1 0 0 0 MIR7641-2,RNA5S10,RNA5S9,RNA5S1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RHOU,RNA5S5,RNA5S6,DUSP5P1,RNA5S15
SE_02_098800665 chr1:228623779-228642214 Sample_02_0988 Blood K562_EPZ 665 7 59 1 0 0 0 MIR7641-2,RNA5S10,RNA5S9,RNA5S1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RHOU,RNA5S5,RNA5S6,DUSP5P1,RNA5S15
SE_02_117900500 chr1:228623782-228642975 Sample_02_1179 Brain GBM08 500 8 59 1 0 0 0 MIR7641-2,RNA5S10,RNA5S9,RNA5S1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RHOU,RNA5S5,RNA5S6,DUSP5P1,RNA5S15
SE_02_098300088 chr1:228623795-228642090 Sample_02_0983 Brain H3.3K27M_BT245-C1P5 88 12 59 1 0 0 0 MIR7641-2,RNA5S9,RNA5S1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RHOU,RNA5S5,RNA5S6,RNA5S10,DUSP5P1,RNA5S15
SE_02_048600190 chr1:228623798-228643414 Sample_02_0486 Bone marrow HSCe_66y_CD34+,CD38-,Lineage- 190 14 59 1 0 0 0 MIR7641-2,RNA5S9,RNA5S1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RHOU,RNA5S5,RNA5S6,RNA5S10,DUSP5P1,RNA5S15
SE_02_049600039 chr1:228623801-228642066 Sample_02_0496 Mammary gland C49R 39 13 59 1 0 0 0 MIR7641-2,RNA5S9,RNA5S1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RHOU,RNA5S5,RNA5S6,RNA5S10,DUSP5P1,RNA5S15
SE_02_098000054 chr1:228623801-228642471 Sample_02_0980 Brain BT245 54 12 59 1 0 0 0 MIR7641-2,RNA5S9,RNA5S1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RHOU,RNA5S5,RNA5S6,RNA5S10,DUSP5P1,RNA5S15
SE_02_072800489 chr1:228623817-228643614 Sample_02_0728 Lymphoma I10_Mantle cell lymphoma tissue_DMSO 489 14 59 1 0 0 0 MIR7641-2,RNA5S9,RNA5S1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RHOU,RNA5S5,RNA5S6,RNA5S10,DUSP5P1,RNA5S15
SE_02_072900372 chr1:228623820-228643670 Sample_02_0729 Lymphoma I10_Mantle cell lymphoma tissue_THZ1 372 13 59 1 0 0 0 MIR7641-2,RNA5S9,RNA5S1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RHOU,RNA5S5,RNA5S6,RNA5S10,DUSP5P1,RNA5S15
SE_02_114400001 chr1:228623823-228642180 Sample_02_1144 Peripheral nerve S462_PRC2 mutant 1 11 59 1 0 0 0 MIR7641-2,RNA5S9,RNA5S1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RHOU,RNA5S5,RNA5S6,RNA5S10,DUSP5P1,RNA5S15
SE_02_106600008 chr1:228623826-228641922 Sample_02_1066 Bone U2-OS 8 13 59 1 0 0 0 MIR7641-2,RNA5S9,RNA5S1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RHOU,RNA5S5,RNA5S6,RNA5S10,DUSP5P1,RNA5S15
SE_02_094100379 chr1:228623834-228642172 Sample_02_0941 Brain T98G 379 8 59 1 0 0 0 MIR7641-2,RNA5S9,RNA5S1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RHOU,RNA5S5,RNA5S6,RNA5S10,DUSP5P1,RNA5S15
SE_02_095500480 chr1:228623835-228642135 Sample_02_0955 Brain IDH1_2469 480 8 59 1 0 0 0 MIR7641-2,RNA5S9,RNA5S1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RHOU,RNA5S5,RNA5S6,RNA5S10,DUSP5P1,RNA5S15
SE_02_096600619 chr1:228623877-228642028 Sample_02_0966 Brain H3.3K27M_JN29-BS3 619 8 59 1 0 0 0 MIR7641-2,RNA5S9,RNA5S1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RHOU,RNA5S5,RNA5S6,RNA5S10,DUSP5P1,RNA5S15
SE_02_046400117 chr1:228623897-228642145 Sample_02_0464 Bone marrow MOLM-13 117 4 59 1 0 0 0 MIR7641-2,RNA5S9,RNA5S1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RHOU,RNA5S5,RNA5S6,RNA5S10,DUSP5P1,RNA5S15
SE_02_112800201 chr1:228623916-228641975 Sample_02_1128 Adipose visceral adipose_CTL_HCTR10 201 15 59 1 0 0 0 MIR7641-2,RNA5S9,RNA5S1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RHOU,RNA5S5,RNA5S6,RNA5S10,DUSP5P1,RNA5S15
SE_02_073100599 chr1:228623930-228643591 Sample_02_0731 Lymphoma J4_Mantle cell lymphoma tissue_THZ1 599 8 59 1 0 0 0 MIR7641-2,RNA5S9,RNA5S1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RHOU,RNA5S5,RNA5S6,RNA5S10,DUSP5P1,RNA5S15
SE_02_102300071 chr1:228623986-228642652 Sample_02_1023 Mammary gland SUM159_BRD7_KO 71 7 59 1 0 0 0 MIR7641-2,RNA5S9,RNA5S1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RHOU,RNA5S5,RNA5S6,RNA5S10,DUSP5P1,RNA5S15
SE_02_087300005 chr1:228624013-228640918 Sample_02_0873 Colon HCT116_siGLIS2.1-5FU 5 8 59 1 0 0 0 MIR7641-2,RNA5S9,RNA5S1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RHOU,RNA5S5,RNA5S6,RNA5S10,DUSP5P1,RNA5S15
SE_02_097300035 chr1:228625795-228647470 Sample_02_0973 Brain H3.3K27M-KO_BT245-c4p6-Rx_R2_cells 35 1 135 9 0 0 150 RNA5S1,DUSP5P1,RHOU,MIR7641-2,RNA5S9,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RNA5S5,RNA5S6,RNA5S10,RNA5S15
SE_02_070200011 chr1:228626671-228642211 Sample_02_0702 Bone David_TC71 11 1 48 1 0 0 0 MIR7641-2,RNA5S9,RNA5S1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RHOU,RNA5S5,RNA5S6,RNA5S10,DUSP5P1,RNA5S15
SE_02_106000298 chr1:228627092-228635157 Sample_02_1060 Bone TC71_SA2 KO 298 1 1 0 0 0 0 MIR7641-2,RNA5S9,RNA5S1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RHOU,RNA5S5,RNA5S6,RNA5S10,DUSP5P1,RNA5S15
SE_02_147800052 chr1:228627134-228649405 Sample_02_1478 Bone EW-3 52 1 179 14 0 0 150 RNA5S1,DUSP5P1,RHOU,MIR7641-2,RNA5S9,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RNA5S5,RNA5S6,RNA5S10,RNA5S15
SE_02_063500006 chr1:228627184-228640028 Sample_02_0635 Synovial sarcoma HSSYII_Untreated 6 1 32 1 0 0 0 MIR7641-2,RNA5S9,RNA5S1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RHOU,RNA5S5,RNA5S6,RNA5S10,DUSP5P1,RNA5S15
SE_02_144500047 chr1:228627216-228648715 Sample_02_1445 Adipose SW872_TAZ4SA 47 1 161 13 0 0 150 RNA5S1,DUSP5P1,RHOU,MIR7641-2,RNA5S9,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RNA5S5,RNA5S6,RNA5S10,RNA5S15
SE_02_098200515 chr1:228628903-228636644 Sample_02_0982 Brain H3.3K27M-KO_BT245-C2P3 515 1 32 1 0 0 0 MIR7641-2,RNA5S1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RHOU,RNA5S5,RNA5S6,RNA5S9,RNA5S10,DUSP5P1,RNA5S15
SE_02_103600765 chr1:228629204-228631234 Sample_02_1036 Mammary gland HCC70_XY018 765 1 0 0 0 0 0 MIR7641-2,RNA5S1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RHOU,RNA5S5,RNA5S6,RNA5S9,RNA5S10,DUSP5P1,RNA5S15
SE_02_099000091 chr1:228629337-228647579 Sample_02_0990 Breast cancer brain metastatic variant MDA-MB-231 BrM2 91 1 116 10 0 0 150 RNA5S1,DUSP5P1,RHOU,MIR7641-2,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RNA5S5,RNA5S6,RNA5S9,RNA5S10,RNA5S15
SE_02_133200035 chr1:228629608-228642520 Sample_02_1332 Blood Monomac6_CTRL 35 1 32 1 0 0 0 MIR7641-2,RNA5S1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RHOU,RNA5S5,RNA5S6,RNA5S9,RNA5S10,DUSP5P1,RNA5S15
SE_02_133100056 chr1:228629633-228641336 Sample_02_1331 Blood Molm13_CTRL 56 1 32 1 0 0 0 MIR7641-2,RNA5S1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RHOU,RNA5S5,RNA5S6,RNA5S9,RNA5S10,DUSP5P1,RNA5S15
SE_02_087100002 chr1:228629637-228642589 Sample_02_0871 Colon HCT116_GLIS2.2-DMSO 2 11 32 1 0 0 0 MIR7641-2,RNA5S1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RHOU,RNA5S5,RNA5S6,RNA5S9,RNA5S10,DUSP5P1,RNA5S15
SE_02_103502178 chr1:228630406-228631187 Sample_02_1035 Mammary gland HCC70_Vehicle 2178 1 0 0 0 0 0 MIR7641-2,RNA5S1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RHOU,RNA5S5,RNA5S6,RNA5S9,RNA5S10,DUSP5P1,RNA5S15
SE_02_142000116 chr1:228630461-228643434 Sample_02_1420 Brain DIPG007 116 6 32 1 0 0 0 MIR7641-2,RNA5S1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RHOU,RNA5S5,RNA5S6,RNA5S9,RNA5S10,DUSP5P1,RNA5S15
SE_02_115000004 chr1:228630476-228642383 Sample_02_1150 Kidney WT 9-12_Nrf2 knockout_vehicle 4 1 32 1 0 0 0 RNA5S1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RHOU,RNA5S5,RNA5S6,MIR7641-2,RNA5S9,RNA5S10,DUSP5P1,RNA5S15
SE_02_068200363 chr1:228632221-228648511 Sample_02_0682 Blood Kasumi-1 363 1 156 12 0 0 150 DUSP5P1,RHOU,MIR7641-2,RNA5S1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RNA5S5,RNA5S6,RNA5S9,RNA5S10,RNA5S15
SE_02_148100487 chr1:228633697-228648620 Sample_02_1481 Bone MIC 487 1 159 13 0 0 150 DUSP5P1,RHOU,MIR7641-2,RNA5S1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RNA5S5,RNA5S6,RNA5S9,RNA5S10,RNA5S15
SE_02_099200182 chr1:228633985-228647709 Sample_02_0992 Mammary gland MDA-MB-231_Par 182 1 122 10 0 0 150 DUSP5P1,RHOU,MIR7641-2,RNA5S1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RNA5S5,RNA5S6,RNA5S9,RNA5S10,RNA5S15
SE_02_098200250 chr1:228636705-228647469 Sample_02_0982 Brain H3.3K27M-KO_BT245-C2P3 250 1 75 8 0 0 150 DUSP5P1,RHOU,MIR7641-2,RNA5S1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RNA5S5,RNA5S6,RNA5S9,RNA5S10,RNA5S15
SE_02_106000159 chr1:228637263-228649358 Sample_02_1060 Bone TC71_SA2 KO 159 1 147 13 0 0 150 DUSP5P1,RHOU,MIR7641-2,RNA5S1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RNA5S5,RNA5S6,RNA5S9,RNA5S10,RNA5S15
SE_02_055500202 chr1:228639148-228649351 Sample_02_0555 Other HAP1_WT 202 1 146 13 0 0 150 DUSP5P1,RHOU,MIR7641-2,RNA5S1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RNA5S5,RNA5S6,RNA5S9,RNA5S10,RNA5S15
SE_02_107100148 chr1:228641770-228646123 Sample_02_1071 Blood Jurkat_WT 148 1 0 0 0 0 150 DUSP5P1,RHOU,MIR7641-2,RNA5S1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RNA5S5,RNA5S6,RNA5S9,RNA5S10,RNA5S15
SE_02_099300658 chr1:228642309-228648630 Sample_02_0993 Blood MOLM-13_empty 658 1 127 12 0 0 150 DUSP5P1,RHOU,MIR7641-2,RNA5S1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RNA5S5,RNA5S6,RNA5S9,RNA5S10,RNA5S15
SE_02_070200106 chr1:228642351-228647629 Sample_02_0702 Bone David_TC71 106 1 88 9 0 0 150 DUSP5P1,RHOU,MIR7641-2,RNA5S1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RNA5S5,RNA5S6,RNA5S9,RNA5S10,RNA5S15
SE_02_099400767 chr1:228642364-228648638 Sample_02_0994 Blood MOLM13_SIK3TQ 767 1 127 12 0 0 150 DUSP5P1,RHOU,MIR7641-2,RNA5S1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RNA5S5,RNA5S6,RNA5S9,RNA5S10,RNA5S15
SE_02_133100328 chr1:228642764-228649221 Sample_02_1331 Blood Molm13_CTRL 328 1 144 13 0 0 150 DUSP5P1,RHOU,MIR7641-2,RNA5S1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RNA5S5,RNA5S6,RNA5S9,RNA5S10,RNA5S15
SE_02_133200383 chr1:228642766-228649189 Sample_02_1332 Blood Monomac6_CTRL 383 1 144 13 0 0 150 DUSP5P1,RHOU,MIR7641-2,RNA5S1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RNA5S5,RNA5S6,RNA5S9,RNA5S10,RNA5S15
SE_02_064000591 chr1:228643595-228648621 Sample_02_0640 Mammary gland MDA-MB-436_DMSO 591 1 127 12 0 0 150 DUSP5P1,RHOU,MIR7641-2,RNA5S1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RNA5S5,RNA5S6,RNA5S9,RNA5S10,RNA5S15
SE_02_140500204 chr1:228645626-228649217 Sample_02_1405 Embryonic kidney HEK293_siBAHD1_W667G_mutant 204 1 144 13 0 0 0 DUSP5P1,RHOU,MIR7641-2,RNA5S1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RNA5S5,RNA5S6,RNA5S9,RNA5S10,RNA5S15
SE_02_140400116 chr1:228645634-228649263 Sample_02_1404 Embryonic kidney HEK293_siBAHD1_WT 116 1 145 13 0 0 0 DUSP5P1,RHOU,MIR7641-2,RNA5S1,RNA5S2,RNA5S3,RNA5S4,RNA5S5,RNA5S6,RNA5S9,RNA5S10,RNA5S15
Genomic distribution of SEs associated with RNA5S1
Genome Browser

The strength of the tissue affected by the gene

Expression of RNA5S1

Cell line (ENCODE) Primary cell (ENCODE)Tissue (NCBI) Normal tissue (GTEx) Cell line (CCLE)