Gene overview

Strategies/Algorithm: closest Ensembl ID: ENSG00000172534
Gene: HCFC1 Gene type: protein_coding
Strand: - External links:
Genomic region: chrX:153947557-153971818 Genome Browser:

Super-enhancer search result of gene-based

SE ID SE Region Sample ID Tissue type Biosample name SE rank Element Common SNP eQTL Risk SNP TFBS CRISPR Cas9 Gene
SE_02_003200459 chrX:153959713-153975156 Sample_02_0032 Pancreas pancreatic-islets-M 459 1 319 17 1 191 1168 HCFC1,TMEM187,MIR718,ARHGAP4,MIR3202-1,NAA10,RENBP,MIR3202-2,IRAK1
SE_02_032900017 chrX:153963394-153975108 Sample_02_0329 Embryo H9_primed 17 1 251 10 1 136 699 HCFC1,TMEM187,MIR718,ARHGAP4,MIR3202-1,NAA10,RENBP,MIR3202-2,IRAK1
SE_02_022500167 chrX:153964539-153975567 Sample_02_0225 Haematopoietic and lymphoid tissue PF-382 167 1 224 9 1 123 531 HCFC1,TMEM187,MIR718,ARHGAP4,MIR3202-1,NAA10,RENBP,MIR3202-2,IRAK1
SE_02_022600417 chrX:153964683-153975795 Sample_02_0226 Blood KOPTK1 417 1 224 9 1 121 502 HCFC1,TMEM187,MIR718,ARHGAP4,MIR3202-1,NAA10,RENBP,MIR3202-2,IRAK1
SE_02_012200102 chrX:153964756-153975398 Sample_02_0122 Haematopoietic and lymphoid tissue TOLEDO 102 1 219 9 1 117 485 HCFC1,TMEM187,MIR718,ARHGAP4,MIR3202-1,NAA10,RENBP,MIR3202-2,IRAK1
SE_02_143100594 chrX:153965066-153975782 Sample_02_1431 Blood T cell 594 1 217 9 1 117 452 HCFC1,TMEM187,HCFC1-AS1,MIR3202-1,NAA10,IRAK1,ARHGAP4,MIR718,MIR3202-2,RENBP
SE_04_000100688 chrX:153965202-153975060 Sample_04_0001 Blood heat shocked K562 688 1 202 9 1 117 452 HCFC1,TMEM187,HCFC1-AS1,MIR3202-1,NAA10,IRAK1,ARHGAP4,MIR718,MIR3202-2,RENBP
SE_01_008400362 chrX:153965202-153975352 Sample_01_0084 Spleen spleen 362 1 209 9 1 117 452 HCFC1,TMEM187,MIR718,ARHGAP4,MIR3202-1,NAA10,RENBP,MIR3202-2,IRAK1
SE_02_001700148 chrX:153965380-153973882 Sample_02_0017 Embryo H9_ESC 148 1 171 8 0 112 452 HCFC1,TMEM187,MIR718,ARHGAP4,MIR3202-1,NAA10,RENBP,MIR3202-2,IRAK1
SE_04_000200767 chrX:153965574-153975403 Sample_04_0002 Blood cold shocked K562 767 1 197 8 1 115 452 HCFC1,TMEM187,HCFC1-AS1,MIR3202-1,NAA10,IRAK1,ARHGAP4,MIR718,MIR3202-2,RENBP
SE_01_003900400 chrX:153965687-153974915 Sample_01_0039 Haematopoietic and lymphoid tissue bone marrow K562 400 1 184 8 1 115 452 HCFC1,TMEM187,MIR718,ARHGAP4,MIR3202-1,NAA10,RENBP,MIR3202-2,IRAK1
SE_02_036900444 chrX:153965754-153974700 Sample_02_0369 Skeletal muscle RD 444 1 178 8 1 115 452 HCFC1,TMEM187,MIR718,ARHGAP4,MIR3202-1,NAA10,RENBP,MIR3202-2,IRAK1
SE_02_037900444 chrX:153965754-153974700 Sample_02_0379 Skeletal muscle RD-Fusion-Negative-Rhabdomyosarcoma 444 1 178 8 1 115 452 HCFC1,TMEM187,MIR718,ARHGAP4,MIR3202-1,NAA10,RENBP,MIR3202-2,IRAK1
SE_01_006900702 chrX:153965764-153975153 Sample_01_0069 Adrenal gland adrenal-gland 702 1 191 8 1 115 452 HCFC1,TMEM187,MIR718,ARHGAP4,MIR3202-1,NAA10,RENBP,MIR3202-2,IRAK1
SE_02_050500645 chrX:153965846-153975106 Sample_02_0505 Esophagus KYSE70_1 645 1 187 8 1 115 452 HCFC1,TMEM187,HCFC1-AS1,MIR3202-1,NAA10,IRAK1,ARHGAP4,MIR718,MIR3202-2,RENBP
SE_02_051600644 chrX:153965846-153975111 Sample_02_0516 Esophagus KYSE70 644 1 187 8 1 115 452 HCFC1,TMEM187,HCFC1-AS1,MIR3202-1,NAA10,IRAK1,ARHGAP4,MIR718,MIR3202-2,RENBP
SE_02_122600204 chrX:153965847-153975249 Sample_02_1226 Bone marrow RPMI-8226 204 1 190 8 1 115 452 HCFC1,TMEM187,HCFC1-AS1,MIR3202-1,NAA10,IRAK1,ARHGAP4,MIR718,MIR3202-2,RENBP
SE_01_008501296 chrX:153965880-153975453 Sample_01_0085 Stomach stomach 1296 1 193 8 1 115 452 HCFC1,TMEM187,MIR718,ARHGAP4,MIR3202-1,NAA10,RENBP,MIR3202-2,IRAK1
SE_02_119300880 chrX:153965936-153974439 Sample_02_1193 Brain GBM27 880 1 168 6 1 115 452 HCFC1,TMEM187,HCFC1-AS1,MIR3202-1,NAA10,IRAK1,ARHGAP4,MIR718,MIR3202-2,RENBP
SE_02_004000225 chrX:153966034-153974404 Sample_02_0040 Embryo PFG 225 2 164 6 1 115 452 HCFC1,TMEM187,MIR718,ARHGAP4,MIR3202-1,NAA10,RENBP,MIR3202-2,IRAK1
SE_01_008200943 chrX:153966054-153975312 Sample_01_0082 Right lobe of liver right-lobe-of-liver 943 1 185 7 1 115 452 HCFC1,TMEM187,MIR718,ARHGAP4,MIR3202-1,NAA10,RENBP,MIR3202-2,IRAK1
SE_02_119600900 chrX:153966075-153974834 Sample_02_1196 Brain GBM32 900 1 175 7 1 115 452 HCFC1,TMEM187,HCFC1-AS1,MIR3202-1,NAA10,IRAK1,ARHGAP4,MIR718,MIR3202-2,RENBP
SE_00_000301139 chrX:153966090-153975154 Sample_00_0003 Adrenal gland adrenal-gland_97d 1139 2 182 7 1 115 452 HCFC1,TMEM187,MIR718,ARHGAP4,MIR3202-1,NAA10,RENBP,MIR3202-2,IRAK1
SE_02_111600451 chrX:153966146-153974894 Sample_02_1116 Haematopoietic and lymphoid tissue bone marrow K562_native 451 1 175 7 1 115 452 HCFC1,TMEM187,HCFC1-AS1,MIR3202-1,NAA10,IRAK1,ARHGAP4,MIR718,MIR3202-2,RENBP
SE_02_003800224 chrX:153966176-153974545 Sample_02_0038 Embryo DE 224 2 166 7 1 115 452 HCFC1,TMEM187,MIR718,ARHGAP4,MIR3202-1,NAA10,RENBP,MIR3202-2,IRAK1
SE_02_003600438 chrX:153966196-153973754 Sample_02_0036 Embryo H7 438 2 152 6 0 112 452 HCFC1,TMEM187,MIR718,ARHGAP4,MIR3202-1,NAA10,RENBP,MIR3202-2,IRAK1
SE_02_027500385 chrX:153966220-153975026 Sample_02_0275 Retina FW14 385 1 176 7 1 115 452 HCFC1,TMEM187,MIR718,ARHGAP4,MIR3202-1,NAA10,RENBP,MIR3202-2,IRAK1
SE_02_003400257 chrX:153966228-153975299 Sample_02_0034 Peripheral blood CUTLL1_GSI 257 1 183 7 1 115 452 HCFC1,TMEM187,MIR718,ARHGAP4,MIR3202-1,NAA10,RENBP,MIR3202-2,IRAK1
SE_02_043100339 chrX:153966229-153975172 Sample_02_0431 Peripheral blood CD34+HSPC-derived-erythroid-precursors 339 1 181 7 1 115 452 HCFC1,TMEM187,MIR718,ARHGAP4,MIR3202-1,NAA10,RENBP,MIR3202-2,IRAK1
SE_02_119100853 chrX:153966294-153974970 Sample_02_1191 Brain GBM25 853 1 173 7 1 115 452 HCFC1,TMEM187,HCFC1-AS1,MIR3202-1,NAA10,IRAK1,ARHGAP4,MIR718,MIR3202-2,RENBP
SE_02_111900400 chrX:153966305-153975489 Sample_02_1119 Blood KBM7 400 1 183 6 1 115 452 HCFC1,TMEM187,HCFC1-AS1,MIR3202-1,NAA10,IRAK1,ARHGAP4,MIR718,MIR3202-2,RENBP
SE_01_009200771 chrX:153966403-153975083 Sample_01_0092 Vagina vagina 771 1 172 6 1 113 452 HCFC1,TMEM187,MIR718,ARHGAP4,MIR3202-1,NAA10,RENBP,MIR3202-2,IRAK1
SE_01_007500713 chrX:153966465-153975132 Sample_01_0075 Esophagus squamous epithelium esophagus-squamous-epithelium 713 1 174 6 1 113 452 HCFC1,TMEM187,MIR718,ARHGAP4,MIR3202-1,NAA10,RENBP,MIR3202-2,IRAK1
SE_00_005500458 chrX:153966512-153975062 Sample_00_0055 Spleen spleen 34y 458 1 171 6 1 113 452 HCFC1,TMEM187,HCFC1-AS1,MIR3202-1,NAA10,IRAK1,ARHGAP4,MIR718,MIR3202-2,RENBP,SSR4,L1CAM,IDH3G
SE_01_007900512 chrX:153966590-153975403 Sample_01_0079 Peyers patch Peyers-patch 512 1 176 6 1 113 452 HCFC1,TMEM187,MIR718,ARHGAP4,MIR3202-1,NAA10,RENBP,MIR3202-2,IRAK1
SE_02_003100707 chrX:153966666-153975411 Sample_02_0031 Haematopoietic and lymphoid tissue blood Jurkat 707 1 176 6 1 113 452 HCFC1,TMEM187,MIR718,ARHGAP4,MIR3202-1,NAA10,RENBP,MIR3202-2,IRAK1
SE_02_118500496 chrX:153966705-153974807 Sample_02_1185 Brain GBM14 496 1 165 6 1 113 452 HCFC1,TMEM187,HCFC1-AS1,MIR3202-1,NAA10,IRAK1,ARHGAP4,MIR718,MIR3202-2,RENBP
SE_02_121900403 chrX:153966884-153974038 Sample_02_1219 Bone marrow H929 403 1 145 5 0 111 452 HCFC1,TMEM187,HCFC1-AS1,MIR3202-1,NAA10,IRAK1,ARHGAP4,MIR718,MIR3202-2,RENBP
SE_02_144500920 chrX:153966926-153974796 Sample_02_1445 Adipose SW872_TAZ4SA 920 1 161 6 1 113 452 HCFC1,TMEM187,HCFC1-AS1,MIR3202-1,NAA10,IRAK1,ARHGAP4,MIR718,MIR3202-2,RENBP
SE_02_147501058 chrX:153966930-153975224 Sample_02_1475 Bone CHLA-25 1058 1 170 6 1 113 452 HCFC1,TMEM187,HCFC1-AS1,MIR3202-1,NAA10,IRAK1,ARHGAP4,MIR718,MIR3202-2,RENBP
SE_02_033100386 chrX:153967012-153975453 Sample_02_0331 Haematopoietic and lymphoid tissue MOLM14_untreated 386 1 171 6 1 113 452 HCFC1,TMEM187,MIR718,ARHGAP4,MIR3202-1,NAA10,RENBP,MIR3202-2,IRAK1
SE_02_119700532 chrX:153967018-153974928 Sample_02_1197 Brain GBM33 532 1 159 6 1 113 452 HCFC1,TMEM187,HCFC1-AS1,MIR3202-1,NAA10,IRAK1,ARHGAP4,MIR718,MIR3202-2,RENBP
SE_02_122000061 chrX:153967022-153974047 Sample_02_1220 Bone marrow JJN3 61 1 141 5 0 111 452 HCFC1,TMEM187,HCFC1-AS1,MIR3202-1,NAA10,IRAK1,ARHGAP4,MIR718,MIR3202-2,RENBP
SE_01_010701367 chrX:153967088-153974758 Sample_01_0107 Esophagus esophagus squamous epithelium 1367 1 157 6 1 113 452 HCFC1,TMEM187,HCFC1-AS1,MIR3202-1,NAA10,IRAK1,ARHGAP4,MIR718,MIR3202-2,RENBP
SE_02_033200376 chrX:153967110-153976202 Sample_02_0332 Haematopoietic and lymphoid tissue MOLM14_DMSO_9 376 1 180 7 1 113 452 HCFC1,TMEM187,MIR718,ARHGAP4,MIR3202-1,NAA10,RENBP,MIR3202-2,IRAK1
SE_02_122100110 chrX:153967166-153974472 Sample_02_1221 Bone marrow KMS11 110 1 148 4 1 113 452 HCFC1,TMEM187,HCFC1-AS1,MIR3202-1,NAA10,IRAK1,ARHGAP4,MIR718,MIR3202-2,RENBP
SE_02_122301041 chrX:153967209-153974746 Sample_02_1223 Bone marrow KMS28BM 1041 1 153 5 1 112 452 HCFC1,TMEM187,HCFC1-AS1,MIR3202-1,NAA10,IRAK1,ARHGAP4,MIR718,MIR3202-2,RENBP
SE_02_040100363 chrX:153967210-153974730 Sample_02_0401 Mammary gland SUM159PT-T47D 363 2 153 5 1 112 452 HCFC1,TMEM187,MIR718,ARHGAP4,MIR3202-1,NAA10,RENBP,MIR3202-2,IRAK1
SE_02_039500204 chrX:153967217-153974328 Sample_02_0395 Mammary gland BT-549 204 1 145 4 1 110 452 HCFC1,TMEM187,MIR718,ARHGAP4,MIR3202-1,NAA10,RENBP,MIR3202-2,IRAK1
SE_02_111200786 chrX:153967269-153975662 Sample_02_1112 T lymphocyte THP-6 T-ALL 786 1 171 5 1 110 452 HCFC1,TMEM187,HCFC1-AS1,MIR3202-1,NAA10,IRAK1,ARHGAP4,MIR718,MIR3202-2,RENBP
SE_02_085701116 chrX:153967443-153974103 Sample_02_0857 Glioblastoma Glioblastoma neurosphere cell_HF-3035 1116 1 138 4 0 108 452 HCFC1,TMEM187,HCFC1-AS1,MIR3202-1,NAA10,IRAK1,ARHGAP4,MIR718,MIR3202-2,RENBP
SE_02_043600122 chrX:153967592-153974952 Sample_02_0436 Kidney HEK293A_empty-vector_DMSO_6h 122 1 153 5 1 110 452 HCFC1,TMEM187,MIR718,ARHGAP4,MIR3202-1,NAA10,RENBP,MIR3202-2,IRAK1
SE_02_097200586 chrX:153967658-153974137 Sample_02_0972 Brain H3.3K27M-KO_BT245-D2p8-Rx_R1_cells 586 1 134 4 1 108 452 HCFC1,TMEM187,HCFC1-AS1,MIR3202-1,NAA10,IRAK1,ARHGAP4,MIR718,MIR3202-2,RENBP
SE_02_096800113 chrX:153967676-153974051 Sample_02_0968 Brain H3.3K27M_pcGBM2p18_cells 113 1 131 4 0 108 452 HCFC1,TMEM187,HCFC1-AS1,MIR3202-1,NAA10,IRAK1,ARHGAP4,MIR718,MIR3202-2,RENBP
SE_02_107000067 chrX:153967792-153972552 Sample_02_1070 Blood SupT1_WT 67 1 105 3 0 96 322 HCFC1,TMEM187,HCFC1-AS1,MIR3202-1,NAA10,IRAK1,ARHGAP4,MIR718,MIR3202-2,RENBP
SE_02_043500136 chrX:153967802-153974756 Sample_02_0435 Kidney HEK293A_WT-MEF2B_DMSO_6h 136 1 143 5 1 110 452 HCFC1,TMEM187,MIR718,ARHGAP4,MIR3202-1,NAA10,RENBP,MIR3202-2,IRAK1
SE_02_093100108 chrX:153967822-153974083 Sample_02_0931 Embryo H9 UTXKO 108 1 126 4 0 108 452 HCFC1,TMEM187,HCFC1-AS1,MIR3202-1,NAA10,IRAK1,ARHGAP4,MIR718,MIR3202-2,RENBP
SE_00_003800619 chrX:153967897-153972614 Sample_00_0038 Spinal cord spinal-cord_108d 619 1 102 3 0 101 340 HCFC1,TMEM187,MIR718,ARHGAP4,MIR3202-1,NAA10,RENBP,MIR3202-2,IRAK1
SE_02_064200061 chrX:153967904-153974890 Sample_02_0642 Mammary gland MDA-MB-436_20C paclitaxel 61 1 142 5 1 110 452 HCFC1,TMEM187,HCFC1-AS1,MIR3202-1,NAA10,IRAK1,ARHGAP4,MIR718,MIR3202-2,RENBP
SE_02_033500421 chrX:153967965-153975709 Sample_02_0335 Haematopoietic and lymphoid tissue MOLM14_CA25_12 421 1 156 5 1 110 452 HCFC1,TMEM187,MIR718,ARHGAP4,MIR3202-1,NAA10,RENBP,MIR3202-2,IRAK1
SE_02_064000046 chrX:153967981-153975008 Sample_02_0640 Mammary gland MDA-MB-436_DMSO 46 1 141 5 1 110 452 HCFC1,TMEM187,HCFC1-AS1,MIR3202-1,NAA10,IRAK1,ARHGAP4,MIR718,MIR3202-2,RENBP
SE_02_011400251 chrX:153968068-153975160 Sample_02_0114 Mammary gland CAL51 251 1 145 5 1 110 452 HCFC1,TMEM187,MIR718,ARHGAP4,MIR3202-1,NAA10,RENBP,MIR3202-2,IRAK1
SE_02_035900491 chrX:153968084-153975107 Sample_02_0359 Colon Colo741 491 1 144 5 1 110 452 HCFC1,TMEM187,MIR718,ARHGAP4,MIR3202-1,NAA10,RENBP,MIR3202-2,IRAK1
SE_02_057500669 chrX:153968138-153975161 Sample_02_0575 Blood MOLM13_sgLKB1e2 669 1 144 5 1 110 452 HCFC1,TMEM187,HCFC1-AS1,MIR3202-1,NAA10,IRAK1,ARHGAP4,MIR718,MIR3202-2,RENBP
SE_02_064300061 chrX:153968162-153974734 Sample_02_0643 Mammary gland MDA-MB-436 61 1 132 5 1 110 452 HCFC1,TMEM187,HCFC1-AS1,MIR3202-1,NAA10,IRAK1,ARHGAP4,MIR718,MIR3202-2,RENBP
SE_02_138200230 chrX:153968169-153975009 Sample_02_1382 Pancreas Pancreatic cancer cells_Triptolide 230 1 136 5 1 110 452 HCFC1,TMEM187,HCFC1-AS1,MIR3202-1,NAA10,IRAK1,ARHGAP4,MIR718,MIR3202-2,RENBP
SE_02_117401035 chrX:153968170-153974330 Sample_02_1174 Brain GBM02 1035 1 123 4 1 108 452 HCFC1,TMEM187,HCFC1-AS1,MIR3202-1,NAA10,IRAK1,ARHGAP4,MIR718,MIR3202-2,RENBP
SE_02_058200531 chrX:153968179-153975143 Sample_02_0582 Blood MOLM13_SIK3TQ_HG 531 1 142 5 1 110 452 HCFC1,TMEM187,HCFC1-AS1,MIR3202-1,NAA10,IRAK1,ARHGAP4,MIR718,MIR3202-2,RENBP
SE_02_085400234 chrX:153968194-153973789 Sample_02_0854 Glioblastoma Glioblastoma neurosphere cell_HF-2354 234 1 112 4 0 107 452 HCFC1,TMEM187,HCFC1-AS1,MIR3202-1,NAA10,IRAK1,ARHGAP4,MIR718,MIR3202-2,RENBP
SE_02_074700320 chrX:153968198-153975182 Sample_02_0747 Embryo ES derived ventricular cardiomyocyte_day80 320 1 141 5 1 110 452 HCFC1,TMEM187,HCFC1-AS1,MIR3202-1,NAA10,IRAK1,ARHGAP4,MIR718,MIR3202-2,RENBP
SE_02_055500193 chrX:153968218-153974874 Sample_02_0555 Other HAP1_WT 193 1 133 5 1 110 452 HCFC1,TMEM187,HCFC1-AS1,MIR3202-1,NAA10,IRAK1,ARHGAP4,MIR718,MIR3202-2,RENBP
SE_02_118900518 chrX:153968219-153974047 Sample_02_1189 Brain GBM22 518 1 115 4 0 108 452 HCFC1,TMEM187,HCFC1-AS1,MIR3202-1,NAA10,IRAK1,ARHGAP4,MIR718,MIR3202-2,RENBP
SE_02_057400572 chrX:153968252-153975194 Sample_02_0574 Blood MOLM-13_sgNeg2 572 1 141 5 1 110 452 HCFC1,TMEM187,HCFC1-AS1,MIR3202-1,NAA10,IRAK1,ARHGAP4,MIR718,MIR3202-2,RENBP
SE_02_001800281 chrX:153968276-153974261 Sample_02_0018 Embryo NEC 281 2 119 4 1 108 452 HCFC1,TMEM187,MIR718,ARHGAP4,MIR3202-1,NAA10,RENBP,MIR3202-2,IRAK1
SE_02_109500502 chrX:153968312-153974809 Sample_02_1095 Blood CD34 Erythroid cells_Don002 502 1 132 5 1 110 452 HCFC1,TMEM187,HCFC1-AS1,MIR3202-1,NAA10,IRAK1,ARHGAP4,MIR718,MIR3202-2,RENBP
SE_02_076100278 chrX:153968334-153974167 Sample_02_0761 Ovary BIN-67_SMARCA4.T910M 278 1 117 4 1 108 452 HCFC1,TMEM187,HCFC1-AS1,MIR3202-1,NAA10,IRAK1,ARHGAP4,MIR718,MIR3202-2,RENBP
SE_02_054500834 chrX:153968370-153974771 Sample_02_0545 Bone marrow K562 WT 834 1 130 5 1 110 452 HCFC1,TMEM187,HCFC1-AS1,MIR3202-1,NAA10,IRAK1,ARHGAP4,MIR718,MIR3202-2,RENBP
SE_02_019400209 chrX:153968399-153974002 Sample_02_0194 Kidney Patient_x750T 209 1 111 4 0 108 452 HCFC1,TMEM187,MIR718,ARHGAP4,MIR3202-1,NAA10,RENBP,MIR3202-2,IRAK1
SE_02_096200850 chrX:153968418-153974233 Sample_02_0962 Brain H3.3K27M_Tumor-derived cell-line_DIPGXIIIp11_cells 850 1 114 4 1 108 452 HCFC1,TMEM187,HCFC1-AS1,MIR3202-1,NAA10,IRAK1,ARHGAP4,MIR718,MIR3202-2,RENBP
SE_02_057800611 chrX:153968425-153974959 Sample_02_0578 Blood MOLM-13_sgSIK3e4 611 1 129 5 1 110 452 HCFC1,TMEM187,HCFC1-AS1,MIR3202-1,NAA10,IRAK1,ARHGAP4,MIR718,MIR3202-2,RENBP
SE_02_058100535 chrX:153968425-153975207 Sample_02_0581 Blood MOLM13_empty_HG 535 1 136 5 1 110 452 HCFC1,TMEM187,HCFC1-AS1,MIR3202-1,NAA10,IRAK1,ARHGAP4,MIR718,MIR3202-2,RENBP
SE_02_120200613 chrX:153968439-153974558 Sample_02_1202 Brain GBM38 613 1 119 5 1 110 452 HCFC1,TMEM187,HCFC1-AS1,MIR3202-1,NAA10,IRAK1,ARHGAP4,MIR718,MIR3202-2,RENBP
SE_02_058400562 chrX:153968509-153974978 Sample_02_0584 Lung H1299 WT 562 1 124 5 1 110 452 HCFC1,TMEM187,HCFC1-AS1,MIR3202-1,NAA10,IRAK1,ARHGAP4,MIR718,MIR3202-2,RENBP
SE_02_036300707 chrX:153968526-153974810 Sample_02_0363 Haematopoietic and lymphoid tissue 697 707 1 121 5 1 110 452 HCFC1,TMEM187,MIR718,ARHGAP4,MIR3202-1,NAA10,RENBP,MIR3202-2,IRAK1
SE_02_057700597 chrX:153968578-153975229 Sample_02_0577 Blood MOLM13_empty 597 1 129 5 1 110 452 HCFC1,TMEM187,HCFC1-AS1,MIR3202-1,NAA10,IRAK1,ARHGAP4,MIR718,MIR3202-2,RENBP
SE_02_158400897 chrX:153968613-153973955 Sample_02_1584 Brain U87 GBM_Mock 897 1 101 4 0 107 452 HCFC1,TMEM187,HCFC1-AS1,MIR3202-1,NAA10,IRAK1,ARHGAP4,MIR718,MIR3202-2,RENBP
SE_02_078800324 chrX:153968637-153973811 Sample_02_0788 Brain 3565 324 1 96 4 0 107 452 HCFC1,TMEM187,HCFC1-AS1,MIR3202-1,NAA10,IRAK1,ARHGAP4,MIR718,MIR3202-2,RENBP
SE_01_010400681 chrX:153968648-153974709 Sample_01_0104 Lung upper lobe of left lung 681 1 112 5 1 110 452 HCFC1,TMEM187,HCFC1-AS1,MIR3202-1,NAA10,IRAK1,ARHGAP4,MIR718,MIR3202-2,RENBP
SE_02_037300501 chrX:153968651-153974854 Sample_02_0373 Skeletal muscle RMS206 501 2 118 5 1 110 452 HCFC1,TMEM187,MIR718,ARHGAP4,MIR3202-1,NAA10,RENBP,MIR3202-2,IRAK1
SE_02_111400049 chrX:153968673-153973707 Sample_02_1114 Embryonic kidney HEK293 49 1 93 4 0 107 452 HCFC1,TMEM187,HCFC1-AS1,MIR3202-1,NAA10,IRAK1,ARHGAP4,MIR718,MIR3202-2,RENBP
SE_02_120000882 chrX:153968688-153973952 Sample_02_1200 Brain GBM36 882 1 97 4 0 107 452 HCFC1,TMEM187,HCFC1-AS1,MIR3202-1,NAA10,IRAK1,ARHGAP4,MIR718,MIR3202-2,RENBP
SE_02_140500044 chrX:153968692-153974272 Sample_02_1405 Embryonic kidney HEK293_siBAHD1_W667G_mutant 44 1 103 4 1 108 452 HCFC1,TMEM187,HCFC1-AS1,MIR3202-1,NAA10,IRAK1,ARHGAP4,MIR718,MIR3202-2,RENBP
SE_02_010800634 chrX:153968700-153974244 Sample_02_0108 Fallopian tube FT246 634 1 101 4 1 108 452 HCFC1,TMEM187,MIR718,ARHGAP4,MIR3202-1,NAA10,RENBP,MIR3202-2,IRAK1
SE_02_061500872 chrX:153968709-153974106 Sample_02_0615 Liposarcoma liposarcoma cells_MLS402 872 1 98 4 0 108 452 HCFC1,TMEM187,HCFC1-AS1,MIR3202-1,NAA10,IRAK1,ARHGAP4,MIR718,MIR3202-2,RENBP
SE_02_107100341 chrX:153968718-153972489 Sample_02_1071 Blood Jurkat_WT 341 1 71 3 0 93 299 HCFC1,HCFC1-AS1,MIR3202-1,NAA10,IRAK1,ARHGAP4,MIR718,MIR3202-2,TMEM187,RENBP
SE_02_039601315 chrX:153968723-153974940 Sample_02_0396 Skin NHEK-D 1315 1 115 5 1 109 452 HCFC1,TMEM187,MIR718,ARHGAP4,MIR3202-1,NAA10,RENBP,MIR3202-2,IRAK1
SE_02_075900457 chrX:153968768-153973896 Sample_02_0759 Ovary BIN-67_Control 457 1 93 4 0 102 452 HCFC1,TMEM187,HCFC1-AS1,MIR3202-1,NAA10,IRAK1,ARHGAP4,MIR718,MIR3202-2,RENBP
SE_02_076000413 chrX:153968773-153973962 Sample_02_0760 Ovary BIN-67_SMARCA4 413 1 94 4 0 103 452 HCFC1,TMEM187,HCFC1-AS1,MIR3202-1,NAA10,IRAK1,ARHGAP4,MIR718,MIR3202-2,RENBP
SE_02_114800013 chrX:153968773-153973989 Sample_02_1148 Kidney WT 9-12_control_vehicle 13 1 94 4 0 103 452 HCFC1,TMEM187,HCFC1-AS1,MIR3202-1,NAA10,IRAK1,ARHGAP4,MIR718,MIR3202-2,RENBP
SE_02_114900037 chrX:153968870-153974653 Sample_02_1149 Kidney WT 9-12_control_Nrf2_SFN 37 1 104 5 1 101 452 HCFC1,TMEM187,HCFC1-AS1,MIR3202-1,NAA10,IRAK1,ARHGAP4,MIR718,MIR3202-2,RENBP
SE_02_006800716 chrX:153968874-153974799 Sample_02_0068 Skin A375_DMSO 716 2 110 5 1 101 452 HCFC1,TMEM187,MIR718,ARHGAP4,MIR3202-1,NAA10,RENBP,MIR3202-2,IRAK1
SE_02_065900547 chrX:153968876-153974871 Sample_02_0659 Lung H23 547 1 110 5 1 101 452 HCFC1,TMEM187,HCFC1-AS1,MIR3202-1,NAA10,IRAK1,ARHGAP4,MIR718,MIR3202-2,RENBP
SE_02_061001012 chrX:153968878-153972541 Sample_02_0610 Liposarcoma MLS 1765-92 1012 1 68 3 0 86 320 HCFC1,TMEM187,HCFC1-AS1,MIR3202-1,NAA10,IRAK1,ARHGAP4,MIR718,MIR3202-2,RENBP
SE_02_060900603 chrX:153968902-153973884 Sample_02_0609 Liposarcoma LPS141 603 1 89 4 0 96 452 HCFC1,TMEM187,HCFC1-AS1,MIR3202-1,NAA10,IRAK1,ARHGAP4,MIR718,MIR3202-2,RENBP
SE_02_102600590 chrX:153968926-153974415 Sample_02_1026 Esophagus KYSE200 590 1 99 4 1 98 452 HCFC1,TMEM187,HCFC1-AS1,MIR3202-1,NAA10,IRAK1,ARHGAP4,MIR718,MIR3202-2,RENBP
SE_02_146900759 chrX:153968937-153974741 Sample_02_1469 Umbilical Vein HUVEC 759 1 104 3 1 98 452 HCFC1,TMEM187,HCFC1-AS1,MIR3202-1,NAA10,IRAK1,ARHGAP4,MIR718,MIR3202-2,RENBP
SE_02_074500031 chrX:153968944-153974081 Sample_02_0745 Embryo ES derived cardiac progenitor cells_day7 31 1 91 2 0 96 452 HCFC1,TMEM187,HCFC1-AS1,MIR3202-1,NAA10,IRAK1,ARHGAP4,MIR718,MIR3202-2,RENBP
SE_02_012500093 chrX:153968985-153974120 Sample_02_0125 Embryo Embryonic-stem-cells_Primed 93 1 90 2 0 96 452 HCFC1,TMEM187,MIR718,ARHGAP4,MIR3202-1,NAA10,RENBP,MIR3202-2,IRAK1
SE_02_093200174 chrX:153968987-153974214 Sample_02_0932 Embryo H9 WT_1 174 1 93 2 1 96 452 HCFC1,TMEM187,HCFC1-AS1,MIR3202-1,NAA10,IRAK1,ARHGAP4,MIR718,MIR3202-2,RENBP
SE_02_074600102 chrX:153969013-153974491 Sample_02_0746 Embryo ES derived primitive cardiomyocite_day15 102 1 98 3 1 95 452 HCFC1,TMEM187,HCFC1-AS1,MIR3202-1,NAA10,IRAK1,ARHGAP4,MIR718,MIR3202-2,RENBP
SE_02_132200606 chrX:153969019-153974054 Sample_02_1322 Connective Tissue HT1080_WT 606 1 90 2 0 93 452 HCFC1,TMEM187,HCFC1-AS1,MIR3202-1,NAA10,IRAK1,ARHGAP4,MIR718,MIR3202-2,RENBP
SE_00_002400739 chrX:153969028-153973730 Sample_00_0024 Embryo mesendoderm 739 2 85 2 0 92 452 HCFC1,TMEM187,MIR718,ARHGAP4,MIR3202-1,NAA10,RENBP,MIR3202-2,IRAK1
SE_02_064500438 chrX:153969040-153973645 Sample_02_0645 Tracheobronchial epithelial HTBE_H1N1_18h 438 1 81 2 0 92 452 HCFC1,TMEM187,HCFC1-AS1,MIR3202-1,NAA10,IRAK1,ARHGAP4,MIR718,MIR3202-2,RENBP
SE_02_054600356 chrX:153969052-153973647 Sample_02_0546 Bone marrow K562_MYO1D Non-hub KO 356 1 81 2 0 91 452 HCFC1,TMEM187,HCFC1-AS1,MIR3202-1,NAA10,IRAK1,ARHGAP4,MIR718,MIR3202-2,RENBP
SE_02_062500442 chrX:153969114-153974612 Sample_02_0625 Mammary gland WS8_4OHT 442 1 99 3 1 94 452 HCFC1,TMEM187,HCFC1-AS1,MIR3202-1,NAA10,IRAK1,ARHGAP4,MIR718,MIR3202-2,RENBP
SE_02_039700290 chrX:153969119-153974088 Sample_02_0397 Mammary gland CAL51-MCF-7 290 1 88 2 0 92 452 HCFC1,TMEM187,MIR718,ARHGAP4,MIR3202-1,NAA10,RENBP,MIR3202-2,IRAK1
SE_02_132100756 chrX:153969125-153973780 Sample_02_1321 Connective Tissue HT1080_FUS-DDIT3 756 1 82 2 0 91 452 HCFC1,TMEM187,HCFC1-AS1,MIR3202-1,NAA10,IRAK1,ARHGAP4,MIR718,MIR3202-2,RENBP
SE_02_096900833 chrX:153969128-153973720 Sample_02_0969 Brain H3.3K27M_PL637 833 1 82 2 0 91 452 HCFC1,TMEM187,HCFC1-AS1,MIR3202-1,NAA10,IRAK1,ARHGAP4,MIR718,MIR3202-2,RENBP
SE_02_081500212 chrX:153969180-153973675 Sample_02_0815 Mammary gland SUM159PT 212 1 79 2 0 91 452 HCFC1,TMEM187,HCFC1-AS1,MIR3202-1,NAA10,IRAK1,ARHGAP4,MIR718,MIR3202-2,RENBP
SE_02_079500520 chrX:153969188-153973166 Sample_02_0795 Brain 1953 520 1 74 2 0 91 452 HCFC1,TMEM187,HCFC1-AS1,MIR3202-1,NAA10,IRAK1,ARHGAP4,MIR718,MIR3202-2,RENBP
SE_02_027400433 chrX:153969207-153973702 Sample_02_0274 Endometriosis hTERT_KD 433 1 81 2 0 91 452 HCFC1,TMEM187,MIR718,ARHGAP4,MIR3202-1,NAA10,RENBP,MIR3202-2,IRAK1
SE_02_052200256 chrX:153969344-153974033 Sample_02_0522 Colon SW620 256 1 85 2 0 92 452 HCFC1,TMEM187,HCFC1-AS1,MIR3202-1,NAA10,IRAK1,ARHGAP4,MIR718,MIR3202-2,RENBP
SE_02_097600394 chrX:153969354-153973751 Sample_02_0976 Brain H3.3K27M-KO_DIPGXIII-c5p5-Rx_R1_cells_h3k27ac 394 1 81 2 0 91 452 HCFC1,TMEM187,HCFC1-AS1,MIR3202-1,NAA10,IRAK1,ARHGAP4,MIR718,MIR3202-2,RENBP
SE_02_065000326 chrX:153969361-153973208 Sample_02_0650 Tracheobronchial epithelial HTBE_H3N2_12h 326 1 73 2 0 91 452 HCFC1,TMEM187,HCFC1-AS1,MIR3202-1,NAA10,IRAK1,ARHGAP4,MIR718,MIR3202-2,RENBP
SE_02_101701684 chrX:153969443-153974378 Sample_02_1017 Embryo H9_Mesendoderm 24h_Hydroxyurea 1684 1 89 1 1 93 452 HCFC1,TMEM187,HCFC1-AS1,MIR3202-1,NAA10,IRAK1,ARHGAP4,MIR718,MIR3202-2,RENBP
SE_02_059100414 chrX:153969503-153974077 Sample_02_0591 PBMCs adult CD4+CD25-CD45RA+CD27+ naive T cells 414 1 83 1 0 92 452 HCFC1,TMEM187,HCFC1-AS1,MIR3202-1,NAA10,IRAK1,ARHGAP4,MIR718,MIR3202-2,RENBP
SE_02_094100531 chrX:153969635-153973825 Sample_02_0941 Brain T98G 531 1 75 1 0 90 452 HCFC1,TMEM187,HCFC1-AS1,MIR3202-1,NAA10,IRAK1,ARHGAP4,MIR718,MIR3202-2,RENBP
SE_02_132000844 chrX:153969660-153973738 Sample_02_1320 Connective Tissue HT1080_EWS-FLI1 844 1 74 1 0 90 452 HCFC1,TMEM187,HCFC1-AS1,MIR3202-1,NAA10,IRAK1,ARHGAP4,MIR718,MIR3202-2,RENBP
SE_02_135101078 chrX:153969680-153973795 Sample_02_1351 Mammary gland MDA-MB-231-Erbeta_vehicle 1078 1 74 1 0 90 452 HCFC1,TMEM187,HCFC1-AS1,MIR3202-1,NAA10,IRAK1,ARHGAP4,MIR718,MIR3202-2,RENBP
SE_02_154100445 chrX:153969690-153973955 Sample_02_1541 Nasopharyngeal HNE1 445 1 78 1 0 90 452 HCFC1,TMEM187,HCFC1-AS1,MIR3202-1,NAA10,IRAK1,ARHGAP4,MIR718,MIR3202-2,RENBP
SE_02_052100474 chrX:153969706-153974010 Sample_02_0521 Colon SW480 474 1 78 1 0 91 452 HCFC1,TMEM187,HCFC1-AS1,MIR3202-1,NAA10,IRAK1,ARHGAP4,MIR718,MIR3202-2,RENBP
SE_02_130500319 chrX:153969710-153973680 Sample_02_1305 Pancreas Gemcitabine resistant L3.6pl 319 1 72 1 0 90 452 HCFC1,TMEM187,HCFC1-AS1,MIR3202-1,NAA10,IRAK1,ARHGAP4,MIR718,MIR3202-2,RENBP
SE_02_098200417 chrX:153969712-153973888 Sample_02_0982 Brain H3.3K27M-KO_BT245-C2P3 417 1 75 1 0 90 452 HCFC1,TMEM187,HCFC1-AS1,MIR3202-1,NAA10,IRAK1,ARHGAP4,MIR718,MIR3202-2,RENBP
SE_02_135300906 chrX:153969745-153973705 Sample_02_1353 Mammary gland MDA-MB-231-Erbeta_TNFa 906 1 70 1 0 90 452 HCFC1,TMEM187,HCFC1-AS1,MIR3202-1,NAA10,IRAK1,ARHGAP4,MIR718,MIR3202-2,RENBP
SE_02_147200859 chrX:153969764-153973664 Sample_02_1472 Fetal lung IMR-90 859 1 67 1 0 90 452 HCFC1,TMEM187,HCFC1-AS1,MIR3202-1,NAA10,IRAK1,ARHGAP4,MIR718,MIR3202-2,RENBP
SE_02_004900715 chrX:153969799-153973838 Sample_02_0049 Embryo endodermal CyT49_GTtoH 715 1 71 1 0 90 452 HCFC1,TMEM187,MIR718,ARHGAP4,MIR3202-1,NAA10,RENBP,MIR3202-2,IRAK1
SE_02_065201363 chrX:153969825-153973647 Sample_02_0652 Tracheobronchial epithelial HTBE_H3N2_mock 1363 1 67 1 0 90 452 HCFC1,TMEM187,HCFC1-AS1,MIR3202-1,NAA10,IRAK1,ARHGAP4,MIR718,MIR3202-2,RENBP
SE_01_005100228 chrX:153969850-153973760 Sample_01_0051 Embryo neural-progenitor-cell 228 1 70 1 0 90 452 HCFC1,TMEM187,MIR718,ARHGAP4,MIR3202-1,NAA10,RENBP,MIR3202-2,IRAK1
SE_02_049400566 chrX:153969893-153973929 Sample_02_0494 Islets differentiated hESCs Late pancreatic progenitor cells 566 1 71 1 0 90 452 HCFC1,TMEM187,HCFC1-AS1,MIR3202-1,NAA10,IRAK1,ARHGAP4,MIR718,MIR3202-2,RENBP
SE_02_094600858 chrX:153969896-153973866 Sample_02_0946 Tongue HN12 858 1 69 1 0 90 452 HCFC1,TMEM187,HCFC1-AS1,MIR3202-1,NAA10,IRAK1,ARHGAP4,MIR718,MIR3202-2,RENBP
SE_02_065100082 chrX:153969949-153973440 Sample_02_0651 Tracheobronchial epithelial HTBE_H3N2_18h 82 1 61 1 0 90 452 HCFC1,TMEM187,HCFC1-AS1,MIR3202-1,NAA10,IRAK1,ARHGAP4,MIR718,MIR3202-2,RENBP
SE_02_142600574 chrX:153970005-153973772 Sample_02_1426 Shoulder fibroblast_341 574 1 66 1 0 90 452 HCFC1,TMEM187,HCFC1-AS1,MIR3202-1,NAA10,IRAK1,ARHGAP4,MIR718,MIR3202-2,RENBP
SE_02_059200368 chrX:153970018-153973618 Sample_02_0592 PBMCs adult CD4+CD25hiCD127lo regulatory T cells 368 1 62 1 0 90 452 HCFC1,TMEM187,HCFC1-AS1,MIR3202-1,NAA10,IRAK1,ARHGAP4,MIR718,MIR3202-2,RENBP
SE_02_142500516 chrX:153970059-153973756 Sample_02_1425 Shoulder fibroblast_384 516 1 63 1 0 90 452 HCFC1,TMEM187,HCFC1-AS1,MIR3202-1,NAA10,IRAK1,ARHGAP4,MIR718,MIR3202-2,RENBP

Genomic distribution of SEs associated with HCFC1

The strength of the tissue affected by the gene


Expression of HCFC1