SEdb 2.0
  1. Search
  2. Super-enhancer search result of gene-based

Gene overview

Strategies/Algorithm: proximal Ensembl ID: ENSG00000199031
Gene: MIR371A Gene type: miRNA
Strand: + External links:
Genomic region: chr19:53787675-53787741 Genome Browser:

Super-enhancer search result of gene-based

GREAT Download bed
SE ID SE Region Sample ID Tissue type Biosample name SE rank Element Common SNP eQTL Risk SNP TFBS CRISPR Cas9 Gene
SE_02_143500433 chr19:53745544-53757314 Sample_02_1435 Trophoblast trophoblast stem cells_MSX2_KD 433 1 481 14 0 0 245 MIR519A1,MIR516A1,MIR522,MIR521-1,MIR527,MIR517C,MIR516B2,MIR519D,MIR526A1,MIR518A2,MIR526A2,MIR517A,MIR516B1,MIR523,MIR1283-2,MIR524,MIR371A,MIR518D,MIR371B,MIR520D,MIR373,MIR518B,MIR521-2,MIR519A2,MIR520C,MIR520B,MIR516A2,MIR518E,MIR518F,MIR520H,MIR372,MIR517B,MIR520G,MIR525,MIR518A1,MIR518C
SE_02_143400951 chr19:53746094-53758180 Sample_02_1434 Trophoblast trophoblast stem cells 951 1 483 13 0 0 261 MIR516A1,MIR522,MIR527,MIR521-1,MIR519A1,MIR517C,MIR516B2,MIR519D,MIR526A1,MIR518A2,MIR526A2,MIR517A,MIR516B1,MIR523,MIR1283-2,MIR524,MIR371A,MIR518D,MIR371B,MIR520D,MIR373,MIR518B,MIR521-2,MIR519A2,MIR520C,MIR520B,MIR516A2,MIR518E,MIR518F,MIR520H,MIR372,MIR517B,MIR520G,MIR525,MIR518A1,MIR518C
SE_02_082200024 chr19:53762010-53775439 Sample_02_0822 Haematopoietic and lymphoid tissue SET-2_insR_DMSO 24 2 520 34 0 0 48 MIR519A2,MIR517C,MIR516B2,MIR519D,MIR518A2,MIR519A1,MIR526A2,MIR517A,MIR516B1,NLRP12,MIR1283-2,MIR516A1,MIR371A,MIR521-1,MIR518D,MIR371B,MIR520D,MIR373,MIR527,MIR521-2,MIR522,MIR516A2,MIR518E,MIR520H,MIR372,MIR517B,MIR520G,MIR518A1
SE_02_082300023 chr19:53762395-53782569 Sample_02_0823 Haematopoietic and lymphoid tissue SET-2_insR_GSK-LSD1 23 3 758 41 0 0 18 MIR519A2,MIR517C,MIR516B2,MIR519D,MIR518A2,MIR519A1,MIR526A2,MIR516B1,NLRP12,MIR1283-2,MIR516A1,MIR371A,MIR521-1,MIR518D,MIR371B,MIR520D,MIR373,MIR527,MIR521-2,MIR522,MIR516A2,MIR518E,MIR520H,MIR372,MIR517B,MIR520G,MIR518A1
SE_02_143400831 chr19:53767682-53776838 Sample_02_1434 Trophoblast trophoblast stem cells 831 1 332 26 0 0 0 MIR517C,MIR516B2,MIR518A2,MIR519A1,MIR526A2,MIR516B1,NLRP12,MIR1283-2,MIR516A1,MIR371A,MIR521-1,MIR518D,MIR371B,MIR520D,MIR373,MIR527,MIR519A2,MIR522,MIR516A2,MIR518E,MIR520H,MIR372,MIR517B,MIR520G,MIR518A1
SE_02_075200170 chr19:53768015-53777915 Sample_02_0752 Embryo ES-derived progenitors_DE_wild type 170 1 349 28 0 0 0 MIR517C,MIR516B2,MIR518A2,MIR519A1,MIR526A2,MIR516B1,NLRP12,MIR1283-2,MIR516A1,MIR371A,MIR521-1,MIR518D,MIR371B,MIR520D,MIR373,MIR527,MIR519A2,MIR522,MIR516A2,MIR518E,MIR520H,MIR372,MIR517B,MIR520G,MIR518A1
SE_02_075500218 chr19:53768030-53778241 Sample_02_0755 Embryo ES-derived progenitors_DE FOXA2 -/- 218 1 368 29 0 0 0 MIR517C,MIR516B2,MIR518A2,MIR519A1,MIR526A2,MIR516B1,NLRP12,MIR1283-2,MIR516A1,MIR371A,MIR521-1,MIR518D,MIR371B,MIR520D,MIR373,MIR527,MIR519A2,MIR522,MIR516A2,MIR518E,MIR520H,MIR372,MIR517B,MIR520G,MIR518A1
SE_02_075300817 chr19:53768051-53776462 Sample_02_0753 Embryo ES-derived progenitors_FG type 817 2 309 26 0 0 0 MIR517C,MIR516B2,MIR518A2,MIR519A1,MIR526A2,MIR516B1,NLRP12,MIR1283-2,MIR516A1,MIR371A,MIR521-1,MIR518D,MIR371B,MIR520D,MIR373,MIR527,MIR519A2,MIR522,MIR516A2,MIR518E,MIR520H,MIR372,MIR517B,MIR520G,MIR518A1
SE_02_075700608 chr19:53768090-53785849 Sample_02_0757 Embryo ES-derived progenitors_FOXA2 -/- 608 5 620 31 1 0 0 MIR517C,MIR516B2,MIR518A2,MIR519A1,MIR526A2,MIR516B1,NLRP12,MIR1283-2,MIR516A1,MIR371A,MIR521-1,MIR518D,MIR371B,MIR520D,MIR373,MIR527,MIR519A2,MIR522,MIR516A2,MIR518E,MIR520H,MIR372,MIR517B,MIR520G,MIR518A1
SE_02_074400457 chr19:53769032-53781448 Sample_02_0744 Embryo ES derived cardiac mesoderm_day5 457 9 445 29 0 0 0 MIR517C,MIR516B2,MIR518A2,MIR519A1,MIR526A2,MIR516B1,NLRP12,MIR1283-2,MIR516A1,MIR371A,MIR521-1,MIR518D,MIR371B,MIR520D,MIR373,MIR527,MIR519A2,MIR522,MIR516A2,MIR518E,MIR520H,MIR372,MIR517B,MIR520G,MIR518A1
SE_02_157200883 chr19:53780989-53786260 Sample_02_1572 iPSCs FiPSC 883 1 186 2 1 0 0 MIR517C,MIR373,MIR527,NLRP12,MIR518A2,MIR372,MIR1283-2,MIR516A1,MIR518D,MIR522,MIR519A2,MIR521-1,MIR516A2,MIR516B1,MIR371A,MIR518A1,MIR371B,MIR519A1,MIR520H
SE_02_156701223 chr19:53781214-53786226 Sample_02_1567 iPSCs CiPSC 1223 1 175 2 1 0 0 MIR517C,MIR373,MIR527,NLRP12,MIR518A2,MIR372,MIR1283-2,MIR516A1,MIR518D,MIR522,MIR519A2,MIR521-1,MIR516A2,MIR516B1,MIR371A,MIR519A1,MIR371B,MIR520H
SE_02_157001003 chr19:53781221-53786084 Sample_02_1570 iPSCs EiPSC 1003 1 170 2 1 0 0 MIR517C,MIR373,MIR527,NLRP12,MIR518A2,MIR372,MIR1283-2,MIR516A1,MIR518D,MIR522,MIR519A2,MIR521-1,MIR516A2,MIR516B1,MIR371A,MIR519A1,MIR371B,MIR520H
SE_02_157000286 chr19:53812068-53842717 Sample_02_1570 iPSCs EiPSC 286 10 1124 32 4 6 217 NLRP12,MIR373,MYADM,MIR372,PRKCG,MIR519A2,MIR371A,MIR371B
SE_02_157200120 chr19:53812098-53842739 Sample_02_1572 iPSCs FiPSC 120 7 1124 32 4 6 217 NLRP12,MIR373,MYADM,MIR372,PRKCG,MIR519A2,MIR371A,MIR371B
SE_02_156700232 chr19:53812115-53842709 Sample_02_1567 iPSCs CiPSC 232 7 1121 32 4 6 217 NLRP12,MIR373,MYADM,MIR372,PRKCG,MIR519A2,MIR371A,MIR371B
SE_02_153000186 chr19:53814586-53881802 Sample_02_1530 Peripheral blood neutrophils_0BA0X 186 15 2140 69 5 95 1302 MYADM,NLRP12,MIR373,MIR372,PRKCG,CACNG7,MIR371A,MIR371B
SE_02_145700138 chr19:53818113-53840649 Sample_02_1457 Embryo HUES8 WT 138 9 864 26 2 5 155 NLRP12,MIR373,MYADM,MIR372,PRKCG,MIR371A,MIR371B
SE_02_086000427 chr19:53818420-53840097 Sample_02_0860 iPSCs SAH_SMARCB1_K364del/+ 427 7 843 26 2 5 155 NLRP12,MIR373,MYADM,MIR372,PRKCG,MIR371A,MIR371B
SE_02_153100309 chr19:53820113-53879826 Sample_02_1531 Peripheral blood neutrophils_0B9ZK 309 18 1883 61 3 94 1240 MYADM,NLRP12,MIR373,MIR372,PRKCG,CACNG7,MIR371A,MIR371B
SE_02_092800114 chr19:53827769-53882669 Sample_02_0928 Peripheral blood neutrophils_Ecoli 114 10 1722 56 4 114 1263 MYADM,PRKCG,MIR373,MIR372,NLRP12,CACNG7,MIR371A,MIR371B
SE_02_074200519 chr19:53828626-53842782 Sample_02_0742 Embryo ESCs_day0 519 8 597 14 1 0 0 MIR373,MYADM,MIR372,NLRP12,PRKCG,MIR371A,MIR371B
SE_02_116000374 chr19:53829285-53842875 Sample_02_1160 Embryo H1_shLuc 374 8 580 10 0 0 0 MIR373,MYADM,MIR372,NLRP12,PRKCG,MIR371A,MIR371B
SE_02_133200345 chr19:53829291-53879946 Sample_02_1332 Blood Monomac6_CTRL 345 14 1616 44 1 89 1085 MYADM,MIR373,MIR372,NLRP12,PRKCG,CACNG7,MIR371A,MIR371B
SE_02_055900414 chr19:53829977-53843135 Sample_02_0559 iPSCs FX52 iPSCs dC-T 414 10 565 9 0 0 0 MIR373,MYADM,MIR372,NLRP12,PRKCG,MIR371A,MIR371B
SE_02_055800599 chr19:53830022-53840168 Sample_02_0558 iPSCs FX52 iPSCs mock 599 7 487 8 0 0 0 MIR373,MYADM,MIR372,NLRP12,PRKCG,MIR371A,MIR371B
SE_02_117200271 chr19:53830045-53842072 Sample_02_1172 Embryo H9 WT 271 3 533 8 0 0 0 MIR373,MYADM,MIR372,NLRP12,PRKCG,MIR371A,MIR371B
SE_02_052900085 chr19:53830887-53838606 Sample_02_0529 Heart Heart-derived sendai virus reprogrammed iPSC 85 7 366 7 0 0 0 MIR373,MYADM,MIR372,NLRP12,PRKCG,MIR371A,MIR371B
SE_02_056000415 chr19:53830994-53842183 Sample_02_0560 iPSCs FX52_Cas9-inactive Tet1_CGG sgRNA 415 7 497 7 0 0 0 MIR373,MYADM,MIR372,NLRP12,PRKCG,MIR371A,MIR371B
SE_02_103000117 chr19:53837331-53910274 Sample_02_1030 Colon DKO 117 23 2042 70 3 315 3252 MYADM,PRKCG,MIR373,MIR372,NLRP12,CACNG7,MIR371A,MIR371B
Genomic distribution of SEs associated with MIR371A
Genome Browser

The strength of the tissue affected by the gene

Expression of MIR371A

Cell line (ENCODE) Primary cell (ENCODE)Tissue (NCBI) Normal tissue (GTEx) Cell line (CCLE)