SEdb 2.0
  1. Search
  2. Super-enhancer search result of gene-based

Gene overview

Strategies/Algorithm: closest_active Ensembl ID: ENSG00000087274
Gene: ADD1 Gene type: protein_coding
Strand: + External links:
Genomic region: chr4:2843857-2930076 Genome Browser:

Super-enhancer search result of gene-based

GREAT Download bed
SE ID SE Region Sample ID Tissue type Biosample name SE rank Element Common SNP eQTL Risk SNP TFBS CRISPR Cas9 Gene
SE_01_008400032 chr4:2785069-2879250 Sample_01_0084 Spleen spleen 32 20 2918 219 3 211 3984 SH3BP2,ADD1,TNIP2
SE_02_143200757 chr4:2822482-2891702 Sample_02_1432 Bone A673 STAG2 WT 757 25 2147 133 4 129 3258 SH3BP2,ADD1,NOP14-AS1,MFSD10
SE_02_089600516 chr4:2823595-2878067 Sample_02_0896 Heart left ventricle_LV1294 516 26 1638 99 1 110 2851 SH3BP2,ADD1
SE_02_089200470 chr4:2823818-2894261 Sample_02_0892 Heart left ventricle_LV1215 470 26 2159 133 4 129 3026 SH3BP2,ADD1,NOP14-AS1,MFSD10
SE_01_009801084 chr4:2823835-2872208 Sample_01_0098 Heart left ventricle_51y 1084 15 1488 92 1 98 2757 SH3BP2,ADD1
SE_02_119300837 chr4:2824983-2870286 Sample_02_1193 Brain GBM27 837 16 1401 86 1 97 2610 SH3BP2,ADD1
SE_02_121300581 chr4:2825791-2895632 Sample_02_1213 Brain GBM31 581 22 2122 131 4 132 2847 SH3BP2,ADD1,NOP14-AS1,MFSD10
SE_02_097700356 chr4:2825855-2894781 Sample_02_0977 Brain 2089_H3.3K27WT 356 21 2097 130 4 132 2837 SH3BP2,ADD1,NOP14-AS1,MFSD10
SE_02_104901003 chr4:2828361-2838172 Sample_02_1049 Peripheral blood CD4+ cell_ROMI 1003 1 385 26 1 52 1651 SH3BP2,ADD1
SE_02_059401402 chr4:2829643-2899836 Sample_02_0594 iPSC-derived neural progenitors 1402 15 2063 120 4 135 2732 SH3BP2,ADD1,NOP14-AS1,MFSD10
SE_02_106900290 chr4:2831685-2872827 Sample_02_1069 Bone marrow Bone marrow aspirate 290 10 1175 65 0 56 1946 SH3BP2,ADD1
SE_02_032000625 chr4:2831717-2872386 Sample_02_0320 Peripheral blood MO1043_ICN1_HA_H3K27Ac_a 625 8 1164 65 0 56 1935 SH3BP2,ADD1
SE_02_098900670 chr4:2832228-2876797 Sample_02_0989 Kidney kidney cortex_WT 670 16 1253 69 0 67 1880 SH3BP2,ADD1
SE_02_112900305 chr4:2833526-2873877 Sample_02_1129 Adipose visceral adipose_CTL_HCTR13 305 19 1110 66 0 52 1617 SH3BP2,ADD1
SE_00_005600805 chr4:2833909-2874507 Sample_00_0056 Sigmoid colon sigmoid colon 3y 805 21 1104 67 0 44 1525 SH3BP2,ADD1
SE_02_103900450 chr4:2834170-2866445 Sample_02_1039 Peripheral blood CD4+ CD7- cells_CTCL1043 450 9 904 52 0 42 1390 SH3BP2,ADD1
SE_02_090800548 chr4:2834651-2893868 Sample_02_0908 Heart left ventricle_DCM_LV1262 548 29 1687 102 3 71 1594 SH3BP2,ADD1,NOP14-AS1,MFSD10
SE_02_091100734 chr4:2834883-2870071 Sample_02_0911 Heart left ventricle_DCM_LV1290 734 11 974 58 0 43 1314 SH3BP2,ADD1
SE_02_091500444 chr4:2834931-2873700 Sample_02_0915 Heart left ventricle_DCM_LV1371 444 17 1057 64 0 43 1301 SH3BP2,ADD1
SE_01_008501258 chr4:2835438-2874747 Sample_01_0085 Stomach stomach 1258 8 1066 65 0 40 1186 SH3BP2,ADD1
SE_02_091000584 chr4:2835494-2873752 Sample_02_0910 Heart left ventricle_DCM_LV1275 584 22 1039 64 0 40 1179 SH3BP2,ADD1
SE_02_091800325 chr4:2835536-2870944 Sample_02_0918 Heart left ventricle_DCM_LV1437 325 15 963 58 0 40 1173 SH3BP2,ADD1
SE_01_008800540 chr4:2836115-2895634 Sample_01_0088 Tibial nerve tibial-nerve 540 12 1695 101 3 74 1407 SH3BP2,ADD1,MFSD10,C4ORF10
SE_02_032701052 chr4:2836210-2872394 Sample_02_0327 Liver hepatocytes_d6 1052 6 980 59 0 39 1054 SH3BP2,ADD1
SE_01_009000338 chr4:2836308-2878422 Sample_01_0090 Lung upper-lobe-of-left-lung 338 6 1130 66 0 51 1089 SH3BP2,ADD1
SE_01_010400448 chr4:2836737-2874657 Sample_01_0104 Lung upper lobe of left lung 448 19 1016 64 0 39 944 SH3BP2,ADD1
SE_02_091200651 chr4:2836882-2878159 Sample_02_0912 Heart left ventricle_DCM_LV1300 651 19 1098 65 0 49 967 SH3BP2,ADD1
SE_02_120500380 chr4:2837147-2901173 Sample_02_1205 Brain NB3 380 25 1810 109 3 92 1587 SH3BP2,ADD1,NOP14-AS1,MFSD10
SE_02_053301156 chr4:2837247-2870238 Sample_02_0533 Blood vessel Circle of Willis_54y 1156 15 898 55 0 37 850 SH3BP2,ADD1
SE_02_090600595 chr4:2837290-2870177 Sample_02_0906 Heart left ventricle_DCM_LV1072 595 12 896 55 0 37 837 SH3BP2,ADD1
SE_02_090401549 chr4:2837323-2871892 Sample_02_0904 Heart left ventricle_DCM_LV1028 1549 14 931 57 0 37 833 SH3BP2,ADD1
SE_02_082700847 chr4:2837466-2852826 Sample_02_0827 Stomach normal gastric 847 4 445 25 0 17 718 SH3BP2,ADD1
SE_02_091301320 chr4:2837495-2870647 Sample_02_0913 Heart left ventricle_DCM_LV1304 1320 14 896 55 0 37 787 SH3BP2,ADD1
SE_00_004900728 chr4:2837580-2874454 Sample_00_0049 Small intestine small intestine 30y 728 12 986 63 0 37 770 SH3BP2,ADD1
SE_02_088800504 chr4:2837696-2894268 Sample_02_0888 Heart left ventricle_LV1160 504 23 1599 99 3 68 1011 SH3BP2,ADD1,NOP14-AS1,MFSD10
SE_02_091900729 chr4:2837713-2870449 Sample_02_0919 Heart left ventricle_DCM_LV1532 729 16 886 54 0 37 738 SH3BP2,ADD1
SE_02_090701137 chr4:2837721-2874022 Sample_02_0907 Heart left ventricle_DCM_LV1223 1137 13 971 61 0 37 738 SH3BP2,ADD1
SE_00_005200824 chr4:2837789-2870481 Sample_00_0052 Heart left ventricle 3y 824 14 883 54 0 37 718 SH3BP2,ADD1
SE_02_089800894 chr4:2837828-2870262 Sample_02_0898 Heart left ventricle_LV1356 894 12 879 54 0 37 707 SH3BP2,ADD1
SE_02_090100907 chr4:2837844-2872088 Sample_02_0901 Heart left ventricle_LV1471 907 23 918 56 0 37 706 SH3BP2,ADD1
SE_02_155400881 chr4:2837854-2874199 Sample_02_1554 Gastrointestinal Stromal GIST-3_KIT e11 881 8 969 61 0 37 704 SH3BP2,ADD1
SE_01_009401010 chr4:2837877-2870399 Sample_01_0094 Gastrocnemius medialis gastrocnemius medialis_54y 1010 9 881 54 0 37 703 SH3BP2,ADD1
SE_01_010900961 chr4:2837880-2874551 Sample_01_0109 Colon transverse colon_54y 961 19 976 62 0 37 700 SH3BP2,ADD1
SE_02_091700619 chr4:2837887-2869575 Sample_02_0917 Heart left ventricle_DCM_LV1433 619 14 860 53 0 37 697 SH3BP2,ADD1
SE_02_089000352 chr4:2837920-2870671 Sample_02_0890 Heart left ventricle_LV1200 352 14 883 54 0 37 695 SH3BP2,ADD1
SE_01_010101109 chr4:2837925-2873427 Sample_01_0101 Pancreas pancreas_54y 1109 13 953 61 0 37 693 SH3BP2,ADD1
SE_02_088900852 chr4:2838125-2894180 Sample_02_0889 Heart left ventricle_LV1183 852 16 1576 97 3 68 917 SH3BP2,ADD1,NOP14-AS1,MFSD10
SE_02_089700558 chr4:2838203-2872072 Sample_02_0897 Heart left ventricle_LV1325 558 15 904 55 0 36 650 SH3BP2,ADD1
SE_02_088700630 chr4:2838248-2870762 Sample_02_0887 Heart left ventricle_LV1121 630 9 871 53 0 36 641 SH3BP2,ADD1
SE_02_089500293 chr4:2838300-2869704 Sample_02_0895 Heart left ventricle_LV1259 293 13 845 53 0 35 634 SH3BP2,ADD1
SE_02_089100983 chr4:2846602-2872129 Sample_02_0891 Heart left ventricle_LV1202 983 17 681 44 0 22 74 ADD1,SH3BP2
SE_02_077502422 chr4:2846859-2891480 Sample_02_0775 Pancreas EndoC-BH1_SE 2422 12 1283 84 3 49 307 ADD1,SH3BP2,NOP14-AS1,MFSD10
SE_02_075200912 chr4:2847127-2888174 Sample_02_0752 Embryo ES-derived progenitors_DE_wild type 912 7 1178 76 3 49 307 ADD1,SH3BP2,NOP14-AS1,MFSD10
SE_02_075500794 chr4:2847188-2886783 Sample_02_0755 Embryo ES-derived progenitors_DE FOXA2 -/- 794 7 1137 75 3 43 217 ADD1,SH3BP2,NOP14-AS1,MFSD10
SE_02_101600793 chr4:2847498-2891905 Sample_02_1016 Embryo H9_Mesendoderm_24h 793 6 1277 81 3 49 307 ADD1,SH3BP2,NOP14-AS1,MFSD10
SE_00_003300521 chr4:2848412-2870468 Sample_00_0033 Psoas muscle psoas-muscle_3y 521 8 584 37 0 20 74 ADD1,SH3BP2
SE_02_108300203 chr4:2849333-2910496 Sample_02_1083 Macula macula 203 21 1729 119 9 143 1379 ADD1,SH3BP2,NOP14-AS1,MFSD10
SE_02_089900623 chr4:2850928-2878202 Sample_02_0899 Heart left ventricle_LV1400 623 11 692 44 0 32 130 ADD1,SH3BP2
SE_02_091600631 chr4:2851464-2870833 Sample_02_0916 Heart left ventricle_DCM_LV1392 631 11 499 34 0 20 74 ADD1,SH3BP2
SE_02_092000627 chr4:2851509-2871795 Sample_02_0920 Heart left ventricle_DCM_LV1535 627 16 522 36 0 20 74 ADD1,SH3BP2
SE_02_090000511 chr4:2851524-2878355 Sample_02_0900 Heart left ventricle_LV1452 511 13 688 44 0 32 130 ADD1,SH3BP2
SE_02_091400633 chr4:2852298-2872842 Sample_02_0914 Heart left ventricle_DCM_LV1342 633 11 527 37 0 20 74 ADD1,SH3BP2
SE_02_101701603 chr4:2852602-2891992 Sample_02_1017 Embryo H9_Mesendoderm 24h_Hydroxyurea 1603 8 1122 76 3 47 307 ADD1,SH3BP2,NOP14-AS1,MFSD10
SE_02_090901281 chr4:2852881-2869511 Sample_02_0909 Heart left ventricle_DCM_LV1264 1281 11 427 29 0 20 74 ADD1,SH3BP2
SE_02_074000884 chr4:2854820-2875158 Sample_02_0740 Muscle RH3 884 8 500 32 0 20 74 ADD1,SH3BP2
SE_02_026200932 chr4:2857277-2882820 Sample_02_0262 Osteoblastic hFOB_JQ1_differentiated 932 4 673 46 2 34 173 ADD1,SH3BP2
SE_02_012400948 chr4:2858189-2884074 Sample_02_0124 Embryo Embryonic-stem-cells_Naive 948 4 693 47 2 34 173 ADD1,SH3BP2
SE_02_006500725 chr4:2859089-2870842 Sample_02_0065 Embryo KO2-Late_G1 725 2 290 20 0 9 74 ADD1,SH3BP2
SE_02_006400938 chr4:2859403-2869077 Sample_02_0064 Embryo DN-Early_G1 938 3 248 17 0 9 74 ADD1,SH3BP2
SE_00_002401035 chr4:2859404-2869488 Sample_00_0024 Embryo mesendoderm 1035 4 256 17 0 9 74 ADD1,SH3BP2
SE_02_032800560 chr4:2859899-2870067 Sample_02_0328 Embryo H9_naive 560 2 257 17 0 9 74 ADD1,SH3BP2
SE_02_120300758 chr4:2861880-2903398 Sample_02_1203 Brain NB1 758 17 1188 71 4 61 1041 ADD1,SH3BP2,NOP14-AS1,MFSD10
SE_02_108200446 chr4:2864608-2908558 Sample_02_1082 Retina retina 446 28 1247 79 7 115 1295 ADD1,SH3BP2,NOP14-AS1,MFSD10
SE_02_003801433 chr4:2864916-2869720 Sample_02_0038 Embryo DE 1433 1 121 8 0 3 74 ADD1,SH3BP2
Genomic distribution of SEs associated with ADD1
Genome Browser

The strength of the tissue affected by the gene

Expression of ADD1

Cell line (ENCODE) Primary cell (ENCODE)Tissue (NCBI) Normal tissue (GTEx) Cell line (CCLE)