General Details

Sample Id:Sample_02_407
Genome:Homo sapiens-hg19
Series: GSE71504
Biosample Type:Cell line
Tissue Type:Brain
Sample Name:BT16
PMID: 27941797|
Data Source:NCBI GEO/SRA

Software and Parameters Used

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Super-enhancer Table



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SE ID Chrome Start End TF Identified by ChIP-seq TF Predicted by Motif Master TF Pathway Element Conservation Visualization
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SE_02_40700520 chr2 178075203 178081710 0 48 1 350 1 0.0794831
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SE_02_40700523 chr6 48065517 48080951 2 34 0 506 2 0.0221136
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SE_02_40700525 chr6 159270036 159276395 2 36 3 281 1 0.0156244
SE_02_40700526 chr19 3364773 3408613 0 129 3 1376 8 -0.0199045
SE_02_40700527 chr9 124022371 124053032 2 97 0 777 5 0.0749476
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SE_02_40700529 chr7 30632835 30638853 0 30 0 205 1 0.0936015
SE_02_40700530 chr18 24056125 24063281 2 46 2 272 1 0.0874571
SE_02_40700531 chr17 58860685 58880860 2 68 2 540 4 0.0676961
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SE_02_40700534 chr12 53871469 53896982 0 95 3 1069 4 0.139444
SE_02_40700535 chr12 6640162 6664499 0 85 3 859 3 0.061211
SE_02_40700536 chr1 23692758 23704601 2 74 3 796 2 0.115126
SE_02_40700537 chr17 59473180 59487762 0 109 2 1149 3 0.142626
SE_02_40700538 chr1 181096955 181112293 2 82 2 821 3 0.0396865
SE_02_40700539 chr14 23445253 23477338 1 84 0 683 3 0.143186
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Master TFs Network

CRC model in Sample_02_407