General Details

Sample Id:Sample_02_405
Genome:Homo sapiens-hg19
Series: GSE71323
Biosample Type:Cell line
Tissue Type:Mammary Gland
Sample Name:ZR-75-30_KO
PMID: 27058665|
Data Source:NCBI GEO/SRA

Software and Parameters Used

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Super-enhancer Table



Using these SE regions to analyze by online tools GREAT
SE ID Chrome Start End TF Identified by ChIP-seq TF Predicted by Motif Master TF Pathway Element Conservation Visualization
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SE_02_40500127 chr1 8136953 8158872 2 44 0 310 6 0.00966268
SE_02_40500128 chr15 93344591 93388688 3 88 3 381 10 0.00690301
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SE_02_40500250 chr21 35916966 35934300 3 43 1 455 5 0.0469751
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SE_02_40500253 chr5 159885461 159908025 3 46 1 517 9 0.0672535
SE_02_40500254 chr2 206549652 206572595 3 41 1 376 7 0.100345
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SE_02_40500257 chr12 125163666 125183589 3 51 2 594 5 -0.00766291
SE_02_40500258 chr17 62696573 62736436 3 79 3 508 9 0.0226465
SE_02_40500259 chr12 63177066 63187874 3 25 2 380 2 0.0383222
SE_02_40500260 chr1 26346048 26362564 3 41 2 366 5 0.109091
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SE_02_40500263 chr13 34728586 34737410 3 22 0 293 4 0.0585513
SE_02_40500264 chr1 155931225 155954321 1 37 2 399 5 0.147153
SE_02_40500265 chr10 104387062 104407058 2 54 1 582 8 0.122373
SE_02_40500266 chr14 50466102 50491162 2 28 2 353 5 0.0461257
SE_02_40500267 chr1 12537175 12545054 3 16 0 223 4 0.0974409
SE_02_40500268 chr7 5459396 5466686 2 41 1 405 3 0.170803
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SE_02_40500270 chrX 45364208 45375712 2 41 1 575 8 0.0854669
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SE_02_40500397 chr7 91455231 91467507 1 19 1 179 4 0.0740851
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SE_02_40500400 chrX 37764309 37782699 1 28 0 270 6 0.0474309
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SE_02_40500402 chr5 34041117 34054601 1 34 0 364 3 0.0962526
SE_02_40500403 chr8 29351420 29388495 3 49 1 337 6 0.0254678
SE_02_40500404 chr5 73838385 73854607 3 37 3 548 4 0.0314121
SE_02_40500405 chr17 67852883 67871322 3 37 2 394 7 0.0283328
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SE_02_40500407 chr19 1250794 1266597 2 48 2 469 6 0.0418068
SE_02_40500408 chr9 130280674 130285959 3 37 0 416 3 0.00469003
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Master TFs Network

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